More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0866 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 244 aa  503  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  86.89 
 
 		 244 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  84.02 
 
 		 244 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  79.1 
 
 		 244 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  63.11 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  48.97 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  48.58 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  46.8 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  45.93 
 
 		 243 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  45.12 
 
 		 243 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  41.8 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  37.72 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  30.18 
 
 		 250 aa  91.7  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  26.75 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  31.14 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  24.35 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  28.94 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  29.09 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  30.05 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  26.43 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  29.8 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08360  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  29.39 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  29.15 
 
 		 309 aa  72  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  30.39 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  26.11 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  26.11 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  26.11 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  26.11 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  26.03 
 
 		 322 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  26.29 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  23.51 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0878  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  24.18 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  25.66 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1544  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  25.22 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  25.66 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  25.23 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3172  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.63 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  25.22 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  25.22 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0993  metallo-beta-lactamase family protein  27.34 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.364222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1107  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1656  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  28.43 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  29.57 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  25.21 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0399  AtsA/ElaC family protein  29.06 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000165635  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  38.04 
 
 		 319 aa  62  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  22.5 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  27.54 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  27.54 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  27.54 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  27.54 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  27.54 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.72 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  22.74 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  25.99 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37507  predicted protein  28.74 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00696771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  23.79 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  23.38 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  27.56 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  27.31 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 395 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0540  PhnP protein  27.07 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.14987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0563  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  27.27 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  28.51 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23.48 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  22.34 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2090  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  30.45 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  28.87 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0810  hypothetical protein  21.51 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.960554  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  27.59 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  30.51 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  22.42 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>