235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3394 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 524 aa  1036    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.52 
 
 		 510 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.29 
 
 		 1343 aa  177  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  33.89 
 
 		 1094 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  34.23 
 
 		 958 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.5 
 
 		 1412 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  32.01 
 
 		 1224 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  30.37 
 
 		 493 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.97 
 
 		 1438 aa  124  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  34.84 
 
 		 1148 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  31.41 
 
 		 959 aa  117  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.7 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.08 
 
 		 1139 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.63 
 
 		 501 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.8 
 
 		 323 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  29.93 
 
 		 1133 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  32.91 
 
 		 644 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.37 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.42 
 
 		 1181 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.72 
 
 		 399 aa  100  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.74 
 
 		 408 aa  100  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.97 
 
 		 1041 aa  97.4  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  30.12 
 
 		 546 aa  96.7  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  29.33 
 
 		 517 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.64 
 
 		 192 aa  94  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.83 
 
 		 1328 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  54.87 
 
 		 180 aa  90.5  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.23 
 
 		 408 aa  90.1  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.7 
 
 		 302 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.96 
 
 		 390 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  29.03 
 
 		 838 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  35.48 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  30.49 
 
 		 1194 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.76 
 
 		 176 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.28 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  28.42 
 
 		 886 aa  77  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  30.93 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.46 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.06 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.36 
 
 		 670 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.73 
 
 		 251 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  31.38 
 
 		 319 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  35.61 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.01 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  32.89 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.27 
 
 		 646 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.6 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.17 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  35.66 
 
 		 320 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  41.6 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  30.61 
 
 		 323 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0719  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  42.86 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.49 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.88 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3966  LigA  30.27 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  25 
 
 		 666 aa  63.9  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.98 
 
 		 831 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.28 
 
 		 824 aa  63.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  31.64 
 
 		 773 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.4 
 
 		 224 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.59 
 
 		 821 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.32 
 
 		 173 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.27 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.78 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.76 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  35.04 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  30.43 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.73 
 
 		 320 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  27.4 
 
 		 643 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.95 
 
 		 157 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2426  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  44.44 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.48 
 
 		 320 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.46 
 
 		 212 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.06 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.02 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1234 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 		 232 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1507  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  42.11 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  27.48 
 
 		 1143 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  29.43 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  40.87 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.55 
 
 		 668 aa  58.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  28.83 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 		 593 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.79 
 
 		 1475 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.22 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0437  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.2 
 
 		 489 aa  57  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000498384  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.95 
 
 		 178 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2038  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  44.34 
 
 		 246 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2128  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.21 
 
 		 175 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.146426  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  52.05 
 
 		 170 aa  55.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2732  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.04 
 
 		 690 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378578  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2742  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.61 
 
 		 121 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0072  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.06 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.81 
 
 		 223 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1874  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.83 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.41 
 
 		 492 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0724  TPR repeat-containing protein  39.78 
 
 		 392 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2916  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  51.85 
 
 		 690 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0883054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>