260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2067 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  62.85 
 
 		 566 aa  662    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  62.5 
 
 		 564 aa  705    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  59.72 
 
 		 563 aa  658    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  60.85 
 
 		 582 aa  674    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  62.14 
 
 		 564 aa  671    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  100 
 
 		 574 aa  1115    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  63.73 
 
 		 566 aa  687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  92.67 
 
 		 575 aa  1053    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  59.93 
 
 		 568 aa  666    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  64.42 
 
 		 563 aa  681    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  64.73 
 
 		 564 aa  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  59.3 
 
 		 567 aa  666    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  60.52 
 
 		 620 aa  626  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  56.07 
 
 		 601 aa  578  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  52.48 
 
 		 611 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  53.02 
 
 		 586 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  53.43 
 
 		 592 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  51.26 
 
 		 588 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  47.09 
 
 		 623 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  49.56 
 
 		 585 aa  482  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  49.55 
 
 		 585 aa  484  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  50.18 
 
 		 610 aa  477  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  46.99 
 
 		 585 aa  474  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  47.37 
 
 		 568 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  47.37 
 
 		 553 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  43.3 
 
 		 547 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  44.78 
 
 		 547 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  44.39 
 
 		 570 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  44.99 
 
 		 547 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  44.26 
 
 		 547 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  45.4 
 
 		 570 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  43.98 
 
 		 548 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  43.98 
 
 		 548 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  44.81 
 
 		 547 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  44.08 
 
 		 547 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  44.26 
 
 		 547 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  44.08 
 
 		 547 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  44.08 
 
 		 547 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  44.08 
 
 		 547 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  44.2 
 
 		 550 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  44.08 
 
 		 547 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  44.67 
 
 		 570 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  43.74 
 
 		 569 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  44.3 
 
 		 562 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  43.84 
 
 		 570 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  43.53 
 
 		 557 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  41.65 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.5 
 
 		 538 aa  365  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  40.44 
 
 		 578 aa  363  4e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  37.88 
 
 		 570 aa  327  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  36.48 
 
 		 563 aa  323  4e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  32.91 
 
 		 511 aa  258  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  32.12 
 
 		 530 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  33.68 
 
 		 544 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  32.96 
 
 		 526 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  30.92 
 
 		 534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  30.76 
 
 		 559 aa  196  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  32.12 
 
 		 548 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0970  L-lactate transport  28.93 
 
 		 506 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.486731  normal  0.0114366 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0381  L-lactate transport  28.75 
 
 		 506 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0849809 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  30.99 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0618  L-lactate permease  26.78 
 
 		 500 aa  167  5.9999999999999996e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  27.79 
 
 		 556 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  27.51 
 
 		 556 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  27.51 
 
 		 556 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0307  L-lactate permease  25.52 
 
 		 510 aa  163  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.284912  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0302  L-lactate permease  25.66 
 
 		 507 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  27.51 
 
 		 556 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1074  L-lactate transport  28.75 
 
 		 506 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  27.46 
 
 		 552 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  27.63 
 
 		 553 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  27.46 
 
 		 552 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  27.46 
 
 		 552 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000746346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  27.46 
 
 		 552 aa  156  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000494573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  27.46 
 
 		 552 aa  156  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000193163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  27.46 
 
 		 552 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000341601  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  28.54 
 
 		 504 aa  156  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  27.86 
 
 		 547 aa  156  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  27.29 
 
 		 553 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000380023  hitchhiker  2.4648700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_002950  PG1340  L-lactate permease  27.21 
 
 		 516 aa  156  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  27.46 
 
 		 552 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000594028  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  28.05 
 
 		 565 aa  156  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  26.77 
 
 		 553 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  26.53 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000505988  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  28.52 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  28.44 
 
 		 545 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  26.61 
 
 		 545 aa  153  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  26.09 
 
 		 576 aa  151  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2529  L-lactate transport  28.83 
 
 		 540 aa  151  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  29.74 
 
 		 545 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  26.51 
 
 		 551 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  27.8 
 
 		 560 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  26.51 
 
 		 551 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  25.84 
 
 		 516 aa  150  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  27.85 
 
 		 564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2258  L-lactate permease  30 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.185279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  26.33 
 
 		 551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  26.33 
 
 		 551 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  27.06 
 
 		 543 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  28.11 
 
 		 551 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>