131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1107 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1107  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.394074  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3945  AsnC family transcriptional regulator  92.39 
 
 		 92 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2704  transcriptional regulator, AsnC family  58.7 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3195  AsnC family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0002664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2687  transcriptional regulator, AsnC family  52.22 
 
 		 91 aa  103  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0967  AsnC family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 95 aa  103  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.201819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1507  AsnC family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0935679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6098  transcriptional regulator, AsnC family  48.35 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2207  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 93 aa  95.9  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00384601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3066  transcriptional regulator, AsnC family  49.45 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0051918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2681  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.65 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10710  transcriptional regulator, AsnC family  47.25 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1458  transcriptional regulator, AsnC family  48.35 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12100  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0479216  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1686  transcriptional regulator, AsnC family  51.11 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2005  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3052  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  46.67 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1895  transcriptional regulator, AsnC family  47.25 
 
 		 93 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0969365  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1944  transcriptional regulator, AsnC family  45.56 
 
 		 93 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0029  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1025  AsnC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190582  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2286  AsnC family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1299  AsnC family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 95 aa  90.1  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2072  transcriptional regulator, AsnC family  43.96 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14210  transcriptional regulator, AsnC family  45.05 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3248  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 92 aa  88.2  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.537577  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3290  AsnC/Lrp family regulatory protein  43.48 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.717659 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1443  transcriptional regulator, AsnC family  41.76 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228364  normal  0.156541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4124  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3522  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527103  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3129  AsnC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 92 aa  84.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1377  transcriptional regulator, AsnC family  41.76 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16160  transcriptional regulator, AsnC family  43.96 
 
 		 93 aa  84  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330214  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5226  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 91 aa  83.6  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3139  transcriptional regulator, AsnC family  41.11 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3337  transcriptional regulator, AsnC family  42.22 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0222  AsnC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15740  transcriptional regulator, AsnC family  41.76 
 
 		 93 aa  80.1  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229331  normal  0.978576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3244  transcriptional regulator, AsnC family  45.05 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032026  hitchhiker  0.0000772239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0884  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0784  AsnC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0061  AsnC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0739  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0383278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0776  transcriptional regulator, AsnC family  35.44 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.221352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0776  transcriptional regulator, AsnC family  35.44 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2790  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258633  normal  0.188192 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0646  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0642  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0489  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1128  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3788  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3611  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3011  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1526  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4117  transcriptional regulator, AsnC family  32.05 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5986  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1585  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0255561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3444  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.838195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4041  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0794181  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0958  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2618  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  32.1 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0651  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1082  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0151  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0672786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2110  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.311997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09180  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.440046  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0100  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5930  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.681612  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_004310  BR0103  transcriptional regulator, putative  30.77 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.196316  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1164  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000232378 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0203  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0212  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0115  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175282  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0863  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8006  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1274  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.58 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.228348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1255  transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.889139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8039  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3613  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.656319  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3705  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6009  transcriptional regulator Lrp family  26.92 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1271  hypothetical protein  31.94 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0226078  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3948  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4452  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683872  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1054  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2150  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1981  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14170  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.353401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1931  AsnC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0869  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1977  AsnC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1911  AsnC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  28.75 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3207  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  38.03 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>