133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5162 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  885    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  44.36 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  40.67 
 
 		 427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  38.13 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  35.7 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  34.69 
 
 		 445 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  37.24 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  36.82 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  35.16 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  36.05 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  37.36 
 
 		 465 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  35.45 
 
 		 470 aa  222  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  38.41 
 
 		 436 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  34.74 
 
 		 482 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  33.85 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  37.12 
 
 		 421 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  36.38 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  35.06 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  32.75 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  32.48 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  33.1 
 
 		 459 aa  190  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  33.96 
 
 		 477 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  35.03 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  33.03 
 
 		 462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  29.63 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  33.18 
 
 		 478 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  31.29 
 
 		 490 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  31 
 
 		 488 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  33.25 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  29.37 
 
 		 493 aa  172  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  30.65 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  30.65 
 
 		 482 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  31.96 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  31.22 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  31.96 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  31.96 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  31.96 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  31.96 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  31.96 
 
 		 432 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  31.96 
 
 		 473 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  30.34 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  30.34 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  30.34 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  29.38 
 
 		 479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  31.85 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  27.65 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  30.63 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  29.67 
 
 		 480 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  29.09 
 
 		 480 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  28.14 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  27.44 
 
 		 798 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  27.25 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  30.25 
 
 		 478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  30.66 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  30.18 
 
 		 478 aa  140  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  31.47 
 
 		 475 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  30.02 
 
 		 478 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  30.02 
 
 		 479 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  30.02 
 
 		 478 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  30.02 
 
 		 479 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  27.21 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  26.57 
 
 		 465 aa  136  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  27.69 
 
 		 485 aa  136  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  28.34 
 
 		 470 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  25.37 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  29.52 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  28.25 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  27.73 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  26.76 
 
 		 480 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  27.18 
 
 		 464 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  26.1 
 
 		 492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  27.52 
 
 		 472 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  28.57 
 
 		 488 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  29.67 
 
 		 479 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  27.52 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  26.63 
 
 		 474 aa  118  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  27.42 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  26.53 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  24.01 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  24.87 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  26.17 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  25.12 
 
 		 431 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  40.69 
 
 		 222 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  27.93 
 
 		 452 aa  97.4  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  38.67 
 
 		 200 aa  96.7  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  24.69 
 
 		 435 aa  93.6  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  26.88 
 
 		 491 aa  92.8  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  25.89 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  27.27 
 
 		 456 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  27.31 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  33.99 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  35.62 
 
 		 542 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  22.96 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0593  hypothetical protein  23.08 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  32.93 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  22.73 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  32.62 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  30.89 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  22.44 
 
 		 480 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1114  protein of unknown function DUF1254  38.05 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>