More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4276 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4276  secretion protein HlyD  100 
 
 		 297 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  57.89 
 
 		 299 aa  340  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4457  secretion protein HlyD family protein  55.4 
 
 		 286 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1266  secretion protein HlyD family protein  55.79 
 
 		 286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4580  secretion protein HlyD family protein  55.05 
 
 		 286 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  54.55 
 
 		 297 aa  322  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  56.29 
 
 		 302 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  53.98 
 
 		 302 aa  318  7e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  55.94 
 
 		 302 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  54.58 
 
 		 286 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  54.23 
 
 		 286 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1585  secretion protein HlyD family protein  57.34 
 
 		 286 aa  315  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.295975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0941  secretion protein HlyD  58.71 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0869  secretion protein HlyD family protein  54.93 
 
 		 289 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2784  secretion protein HlyD family protein  56.29 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal  0.332105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1343  aromatic acid efflux system EmrA subfamily membrane fusion protein  55.21 
 
 		 291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0427147  normal  0.910085 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1697  putative fusaric acid resistance protein  58.04 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420489  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1675  putative fusaric acid resistance protein  58.04 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1465  hypothetical protein  58.04 
 
 		 293 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0932  hypothetical protein  58.04 
 
 		 293 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0416  hypothetical protein  58.04 
 
 		 293 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0746  hypothetical protein  58.04 
 
 		 293 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1367  secretion protein HlyD family protein  54.55 
 
 		 292 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455024  normal  0.947331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1328  secretion protein HlyD family protein  54.55 
 
 		 292 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1851  FusE  57.75 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4591  HlyD family secretion protein  54.23 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2628  HlyD family secretion protein  56.99 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1869  secretion protein HlyD family protein  54.9 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0964  secretion protein HlyD  54.93 
 
 		 291 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000197103  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1446  secretion protein HlyD family protein  54.93 
 
 		 291 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1424  secretion protein HlyD family protein  54.93 
 
 		 291 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  47.95 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0203  secretion protein HlyD family protein  47.06 
 
 		 291 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0178  secretion protein HlyD family protein  46.71 
 
 		 291 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.590801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5460  RND family efflux transporter MFP subunit  46.39 
 
 		 337 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421002  normal  0.0498153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0199  secretion protein HlyD family protein  46.37 
 
 		 291 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.232672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  45.83 
 
 		 288 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5049  secretion protein HlyD family protein  46.37 
 
 		 291 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2637  secretion protein HlyD family protein  48.59 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1810  secretion protein HlyD family protein  48.59 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.931488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  48.56 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2614  aromatic acid efflux pump, membrane fusion protein  47.64 
 
 		 334 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  45.1 
 
 		 288 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2162  secretion protein HlyD family protein  48.57 
 
 		 291 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  44.68 
 
 		 289 aa  258  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  52.12 
 
 		 317 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.6 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  43.11 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  44.26 
 
 		 295 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.15 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0706  HlyD family secretion protein  45.1 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  46.29 
 
 		 289 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0238  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.5 
 
 		 315 aa  251  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  46.29 
 
 		 289 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  47.22 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  45.63 
 
 		 288 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6625  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.62 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  45.88 
 
 		 304 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4265  secretion protein HlyD family protein  45.23 
 
 		 288 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.8 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  46.69 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0869  secretion protein HlyD family protein  51.97 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.74 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5690  HlyD family secretion protein  45.42 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1399  secretion protein HlyD family protein  44.33 
 
 		 302 aa  242  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4791  putative secretion protein HlyD family  46.34 
 
 		 328 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  46.56 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  44.06 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0482  RND family efflux transporter MFP subunit  43.26 
 
 		 351 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.371708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  48.29 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4754  secretion protein HlyD family protein  46.36 
 
 		 359 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0178648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2985  secretion protein HlyD family protein  46.59 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  46.02 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  43.36 
 
 		 294 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5769  RND family efflux transporter MFP subunit  45.67 
 
 		 322 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6659  RND family efflux transporter MFP subunit  44.64 
 
 		 324 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6179  RND family efflux transporter MFP subunit  44.64 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.641102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6013  RND family efflux transporter MFP subunit  45.33 
 
 		 331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7724  HlyD family secretion protein  44.52 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  38.08 
 
 		 287 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  38.08 
 
 		 287 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  41.07 
 
 		 285 aa  231  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1821  hypothetical protein  49.43 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.71 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  38.08 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  40.71 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  40.71 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  40.71 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  40.71 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  40.71 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  40.71 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  40.36 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21290  hypothetical protein  49.05 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  37.72 
 
 		 287 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4082  secretion protein HlyD  47.39 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  40.29 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6150  RND family efflux transporter MFP subunit  47.08 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.268318 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0109  FusE-MFP/HlyD family membrane protein  45.45 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3168  secretion protein HlyD family protein  44.06 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279775  normal  0.690757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>