92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0627 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 655 aa  1369    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  55.64 
 
 		 652 aa  691    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  48.52 
 
 		 668 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  46.35 
 
 		 684 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  30.52 
 
 		 745 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  28.71 
 
 		 693 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.65 
 
 		 691 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  27.58 
 
 		 693 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  27.58 
 
 		 693 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  27.02 
 
 		 684 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  29.25 
 
 		 676 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  27.88 
 
 		 681 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0629  putative phospholipase  75.76 
 
 		 66 aa  103  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0511274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  24.72 
 
 		 818 aa  75.5  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  44.87 
 
 		 512 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.66 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  27.71 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.54 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  27.71 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  44.93 
 
 		 470 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  29.71 
 
 		 714 aa  61.6  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 735 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  28.5 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  26.95 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  28 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  26.79 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  25.69 
 
 		 572 aa  57  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  36.84 
 
 		 517 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  29.03 
 
 		 483 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.45 
 
 		 497 aa  57  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  27.12 
 
 		 730 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.6 
 
 		 701 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.92 
 
 		 521 aa  54.3  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  52.94 
 
 		 714 aa  54.3  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.14 
 
 		 498 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  40.7 
 
 		 512 aa  51.6  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  35.14 
 
 		 504 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  26.59 
 
 		 491 aa  51.2  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.69 
 
 		 514 aa  50.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  33.06 
 
 		 518 aa  50.8  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  32.24 
 
 		 714 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 505 aa  50.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  27.53 
 
 		 516 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  27.44 
 
 		 504 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  27.53 
 
 		 516 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  27.53 
 
 		 510 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 505 aa  50.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0911  phospholipase D/transphosphatidylase  26.52 
 
 		 439 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  0.476132 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  22.53 
 
 		 759 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.03 
 
 		 546 aa  48.9  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.83 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  31.25 
 
 		 738 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.26 
 
 		 513 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  55 
 
 		 270 aa  48.9  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  34.02 
 
 		 1103 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.14 
 
 		 507 aa  48.5  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  36.99 
 
 		 735 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  26.19 
 
 		 734 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  26.19 
 
 		 754 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  26.19 
 
 		 754 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  23.64 
 
 		 515 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  55.56 
 
 		 728 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  23.79 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.98 
 
 		 713 aa  47  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  60 
 
 		 801 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  25.14 
 
 		 720 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  55.56 
 
 		 728 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  55.32 
 
 		 1783 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  25.17 
 
 		 479 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.04 
 
 		 498 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  27.45 
 
 		 490 aa  46.6  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  40 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  48.89 
 
 		 780 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  30.77 
 
 		 482 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  24 
 
 		 479 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  39.73 
 
 		 833 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.71 
 
 		 632 aa  45.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  50 
 
 		 533 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  61.76 
 
 		 775 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  62.16 
 
 		 1821 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  29.84 
 
 		 478 aa  44.3  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  62.16 
 
 		 1522 aa  44.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  26.28 
 
 		 717 aa  44.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  25.31 
 
 		 803 aa  44.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.84 
 
 		 517 aa  44.3  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  36.73 
 
 		 484 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  24.5 
 
 		 481 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30 
 
 		 382 aa  43.9  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1543  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 377 aa  43.9  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0120705  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  39.13 
 
 		 509 aa  43.9  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  39.13 
 
 		 509 aa  43.9  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  24.5 
 
 		 479 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>