74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5272 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  320  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  55 
 
 		 159 aa  184  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  48.41 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  41.94 
 
 		 173 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  34.96 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  30.07 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  31.85 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  37.23 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  35.48 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  34.53 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  38.2 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  32.86 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  36.97 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  36.97 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3123  hypothetical protein  37.08 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  31.06 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  33.62 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  32.76 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  35.4 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  36.46 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  35.29 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  34.34 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  39.66 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  33.08 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  28.75 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  34.78 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  34.78 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  34.78 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2273  hypothetical protein  47.37 
 
 		 62 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0784666  hitchhiker  0.00253392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  36.23 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  29.2 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  28.75 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5423  hypothetical protein  35.4 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  31.3 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  36.08 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  34.74 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  34.74 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  27.54 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  37.68 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  37.68 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  28.99 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  30.7 
 
 		 189 aa  48.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  28.26 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  39.66 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  32.91 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  33.68 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  33.68 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  33.68 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  33.68 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  30.82 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  33.68 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  29.71 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  37.68 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  33.73 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  28.97 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  27.91 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2341  hypothetical protein  24.42 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  27.54 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  31.03 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  30.99 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  31.52 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  27.84 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  33.71 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  30.19 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  28.1 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  30.43 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  31.67 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  31.94 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2069  hypothetical protein  35.19 
 
 		 107 aa  40.4  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.473334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>