More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3486 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  100 
 
 
303 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  91.42 
 
 
303 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  74.33 
 
 
306 aa  484  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  71.71 
 
 
304 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  71.05 
 
 
304 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  69.08 
 
 
303 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  62.37 
 
 
296 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  60 
 
 
302 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  59.73 
 
 
304 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  59.14 
 
 
310 aa  346  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  58.19 
 
 
307 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  57.19 
 
 
307 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  55.37 
 
 
299 aa  338  8e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  54.93 
 
 
312 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  57.91 
 
 
308 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  56.76 
 
 
315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  55.15 
 
 
308 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  54.03 
 
 
304 aa  325  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  57.58 
 
 
302 aa  323  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  53.18 
 
 
304 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  52.54 
 
 
300 aa  322  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  56.38 
 
 
316 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  55.56 
 
 
312 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  55.88 
 
 
313 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  54.75 
 
 
322 aa  318  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  53.95 
 
 
316 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  53.95 
 
 
313 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  53.95 
 
 
313 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  53.95 
 
 
313 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  53.95 
 
 
313 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  51.97 
 
 
316 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  50.99 
 
 
332 aa  297  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  48.88 
 
 
350 aa  291  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  49.68 
 
 
357 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  47.6 
 
 
352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  49.2 
 
 
324 aa  282  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  49.68 
 
 
353 aa  281  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  47.59 
 
 
310 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  46.79 
 
 
362 aa  279  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  46.2 
 
 
368 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  48.78 
 
 
323 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  45.43 
 
 
366 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  46.03 
 
 
363 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  48.36 
 
 
281 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  46.86 
 
 
372 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  48.78 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  50.72 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  47.84 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  48.08 
 
 
328 aa  252  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  45.19 
 
 
327 aa  252  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  50.35 
 
 
281 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44.41 
 
 
407 aa  248  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  47.27 
 
 
281 aa  249  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  43.55 
 
 
371 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  43.99 
 
 
295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  43.98 
 
 
415 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  43.11 
 
 
314 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  39.06 
 
 
338 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  38.38 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  41.72 
 
 
533 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  38.89 
 
 
338 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  40.07 
 
 
338 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  40.73 
 
 
343 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  39.2 
 
 
325 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.28 
 
 
406 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  42.09 
 
 
334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  40.89 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  37.38 
 
 
318 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  37.78 
 
 
342 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  36.79 
 
 
340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  48.37 
 
 
183 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  48.37 
 
 
183 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  36.93 
 
 
351 aa  168  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  34.32 
 
 
545 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  32.57 
 
 
340 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  34.07 
 
 
339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.91 
 
 
306 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  61.02 
 
 
131 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  61.02 
 
 
131 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.1 
 
 
307 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  33.66 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  40.38 
 
 
353 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.1 
 
 
334 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.92 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  27.3 
 
 
398 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  33.61 
 
 
477 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  31.82 
 
 
297 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.15 
 
 
581 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  31.25 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  39.71 
 
 
197 aa  95.9  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  30.15 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  30.68 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.27 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.27 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.53 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.97 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.63 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.1 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.1 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2715  gluconolactonase-like protein  43.97 
 
 
123 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>