More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2274 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  100 
 
 		 346 aa  663    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  93.35 
 
 		 346 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  65.71 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  64.24 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  59.83 
 
 		 346 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  62.85 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  61.01 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0704  iron compound ABC transporter, permease protein  65.18 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  61.61 
 
 		 346 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0755  iron compound ABC transporter, permease protein  64.86 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  60.24 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  58.14 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  59.94 
 
 		 336 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  60.45 
 
 		 335 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1137  transport system permease protein  63.61 
 
 		 342 aa  345  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1361  transport system permease protein  58.86 
 
 		 357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2417  transport system permease protein  60.26 
 
 		 339 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3278  transport system permease protein  59.94 
 
 		 338 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2057  transport system permease protein  60.26 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.441726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  52.74 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  52.27 
 
 		 338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3391  ABC Fe3+-siderophores transporter, inner membrane subunit  60.58 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.581639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3037  transport system permease protein  60.58 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  53.5 
 
 		 340 aa  282  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0442  transport system permease protein  53.85 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17620  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.71 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  41.61 
 
 		 351 aa  212  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  41.28 
 
 		 381 aa  212  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  41.12 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  39.33 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2654  transport system permease protein  47.87 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00408489  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.31 
 
 		 367 aa  202  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  41.19 
 
 		 360 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  40.28 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  40 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  40.06 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  43.37 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  40.25 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  38.75 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  40.65 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  36.88 
 
 		 362 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  38.75 
 
 		 363 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1300  transport system permease protein  49.82 
 
 		 348 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  40.32 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  36.62 
 
 		 350 aa  186  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.37 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2583  transport system permease protein  44.98 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  38.22 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  40.12 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  36.65 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  40.97 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1427  transport system permease protein  41.53 
 
 		 364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  34.2 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.06 
 
 		 330 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1461  transport system permease protein  40.88 
 
 		 323 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.12 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.12 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  38.14 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  38.71 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  40 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  38.01 
 
 		 346 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23970  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.1 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.597722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  34.49 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3575  transport system permease protein  40.33 
 
 		 332 aa  179  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5059  transport system permease protein  40.95 
 
 		 358 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.344774 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  40.89 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  41.51 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  38.08 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  37.5 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  41.28 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  34.02 
 
 		 355 aa  175  8e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  37.74 
 
 		 370 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04380  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.81 
 
 		 389 aa  175  9e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  38.55 
 
 		 341 aa  175  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  39.23 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  38.83 
 
 		 355 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.94 
 
 		 350 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4276  transport system permease protein  39.32 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  36.4 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  39.17 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1577  transport system permease protein  41.84 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  40.43 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  36.59 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  37.24 
 
 		 361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3911  transport system permease protein  44.72 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000192945  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  33.87 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  37.46 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2248  transport system permease protein  39.44 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  32.7 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  36.9 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.89 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  37.8 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  40.91 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  38.68 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  39.5 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  36.83 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  41.73 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  39.24 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5018  ABC transporter membrane spanning protein (iron (III))  35.58 
 
 		 327 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>