More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1760 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.95 
 
 		 742 aa  1186    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  78.2 
 
 		 741 aa  1151    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 743 aa  1459    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.8 
 
 		 758 aa  684    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.93 
 
 		 741 aa  1138    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  77.93 
 
 		 741 aa  1143    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.45 
 
 		 740 aa  1229    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.85 
 
 		 741 aa  1025    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.77 
 
 		 728 aa  586  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.3 
 
 		 615 aa  578  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 		 692 aa  519  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.42 
 
 		 692 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 		 692 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  48.95 
 
 		 700 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.9 
 
 		 692 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  45.01 
 
 		 692 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  43.31 
 
 		 685 aa  458  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 		 738 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0456876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.7 
 
 		 569 aa  343  9e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 		 563 aa  330  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.99 
 
 		 569 aa  330  8e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 579 aa  313  5.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 		 543 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 		 545 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 		 545 aa  254  6e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 		 677 aa  204  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  27.01 
 
 		 564 aa  198  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04070  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  30.77 
 
 		 551 aa  191  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2480  ABC transporter, permease protein, putative  29.41 
 
 		 568 aa  191  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 		 585 aa  188  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.15 
 
 		 585 aa  177  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 		 603 aa  177  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000764  ABC transporter, permease protein  28.18 
 
 		 574 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  29.35 
 
 		 585 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  27.97 
 
 		 583 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 		 592 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  27.11 
 
 		 552 aa  174  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  27.29 
 
 		 583 aa  174  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04881  molybdenum ABC transporter ModB  28.1 
 
 		 574 aa  174  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  27.97 
 
 		 585 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  27.29 
 
 		 583 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.55 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 		 585 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 		 576 aa  169  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.04 
 
 		 550 aa  168  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.66 
 
 		 587 aa  167  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.66 
 
 		 587 aa  167  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 		 563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 		 579 aa  166  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5872  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.82 
 
 		 580 aa  164  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0388795  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 		 550 aa  163  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 		 545 aa  163  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.72 
 
 		 551 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.72 
 
 		 592 aa  161  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 		 574 aa  160  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  27.6 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2744  ABC transporter binding protein inner membrane protein  29.06 
 
 		 574 aa  160  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.928371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 574 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.73 
 
 		 572 aa  158  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.22 
 
 		 570 aa  156  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.02178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5524  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.05 
 
 		 580 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.07 
 
 		 574 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  25.94 
 
 		 575 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  26.19 
 
 		 575 aa  154  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.53 
 
 		 568 aa  153  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3137  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.14 
 
 		 575 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000101117 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 		 559 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.69 
 
 		 574 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.78 
 
 		 608 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.05 
 
 		 574 aa  147  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.55 
 
 		 564 aa  144  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.69 
 
 		 554 aa  144  9e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.6 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.23 
 
 		 551 aa  139  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.25 
 
 		 561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.82 
 
 		 547 aa  135  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.24 
 
 		 544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 		 600 aa  132  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.147749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  26.58 
 
 		 587 aa  131  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 		 732 aa  129  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21310  ABC transporter, permease component  24.81 
 
 		 575 aa  127  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0856621  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.65 
 
 		 551 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.31 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.52 
 
 		 611 aa  125  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.998678  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3160  hypothetical protein  23.61 
 
 		 572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.29 
 
 		 606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 		 592 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1867  putative ABC transporter, permease protein  24.07 
 
 		 556 aa  121  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.87 
 
 		 609 aa  120  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1564  iron/thiamine ABC transporter permease/Zn-dependent hydrolase  23.71 
 
 		 556 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0823842  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.05 
 
 		 616 aa  119  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0013556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0183  ABC transporter, permease protein  23.54 
 
 		 602 aa  118  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.359754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.47 
 
 		 608 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.01 
 
 		 557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.75 
 
 		 560 aa  115  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.01 
 
 		 545 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.34 
 
 		 600 aa  110  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219645 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1754  putative ABC transporter, permease protein  23.58 
 
 		 556 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.38 
 
 		 541 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>