More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0411 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  55.13 
 
 		 1047 aa  1160    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.13 
 
 		 1047 aa  1160    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  36.43 
 
 		 1034 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  53.17 
 
 		 1045 aa  1113    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  52.29 
 
 		 1049 aa  1117    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  35.39 
 
 		 1053 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  55.07 
 
 		 1070 aa  1143    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  54.46 
 
 		 1052 aa  1130    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  55.78 
 
 		 1040 aa  1157    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  55.47 
 
 		 1068 aa  1161    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.8 
 
 		 1070 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  72.63 
 
 		 1066 aa  1573    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  55.94 
 
 		 1047 aa  1160    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  36.36 
 
 		 1064 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  53.89 
 
 		 1039 aa  1109    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  56.97 
 
 		 1055 aa  1196    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  54.64 
 
 		 1052 aa  1146    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  52.72 
 
 		 1045 aa  1106    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  52 
 
 		 1045 aa  1100    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  52.68 
 
 		 1045 aa  1100    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  35.69 
 
 		 1053 aa  652    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  55.07 
 
 		 1070 aa  1143    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  36.61 
 
 		 1077 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  51.87 
 
 		 1047 aa  1097    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  35.9 
 
 		 1049 aa  685    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  35.73 
 
 		 1052 aa  665    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  35.68 
 
 		 1054 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  52.43 
 
 		 1045 aa  1121    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  53.37 
 
 		 1061 aa  1121    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  86.06 
 
 		 1043 aa  1840    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  89.65 
 
 		 1051 aa  1900    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  79.96 
 
 		 1044 aa  1683    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  36.71 
 
 		 1077 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  53.34 
 
 		 1047 aa  1156    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  51.28 
 
 		 1100 aa  1033    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  35.57 
 
 		 1075 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  37.57 
 
 		 1059 aa  689    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  55.02 
 
 		 1060 aa  1155    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  52.86 
 
 		 1045 aa  1123    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  68.14 
 
 		 1058 aa  1458    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  55.28 
 
 		 1070 aa  1141    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.71 
 
 		 1077 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  86.25 
 
 		 1059 aa  1841    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  49.4 
 
 		 1091 aa  1034    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  56.67 
 
 		 1067 aa  1165    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  51.33 
 
 		 1074 aa  1070    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  55.07 
 
 		 1056 aa  1159    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  34.88 
 
 		 1050 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  57.13 
 
 		 1074 aa  1255    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.67 
 
 		 1070 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  52.69 
 
 		 1045 aa  1135    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  35.96 
 
 		 1034 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  53.54 
 
 		 1039 aa  1144    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  35.14 
 
 		 1065 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  54.36 
 
 		 1054 aa  1103    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  55.07 
 
 		 1070 aa  1143    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  44.94 
 
 		 1015 aa  895    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  35.51 
 
 		 1040 aa  644    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  69.15 
 
 		 1059 aa  1504    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  55.81 
 
 		 1063 aa  1173    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  36.33 
 
 		 1077 aa  666    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  50.96 
 
 		 1094 aa  1051    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  67.82 
 
 		 1051 aa  1441    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  52.29 
 
 		 1048 aa  1097    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  100 
 
 		 1043 aa  2100    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  56.17 
 
 		 1039 aa  1185    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  36.1 
 
 		 1054 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  55.38 
 
 		 1042 aa  1160    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  55.23 
 
 		 1042 aa  1147    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  67.82 
 
 		 1052 aa  1456    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  36.18 
 
 		 1031 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36.16 
 
 		 1040 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  36.16 
 
 		 1046 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  56.27 
 
 		 1056 aa  1174    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  35.81 
 
 		 1083 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  47.26 
 
 		 1049 aa  984    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  53.82 
 
 		 1042 aa  1139    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  54.76 
 
 		 1048 aa  1158    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  67.31 
 
 		 1043 aa  1448    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  55.27 
 
 		 1068 aa  1145    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  55.76 
 
 		 1056 aa  1164    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  35.62 
 
 		 1028 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  68.36 
 
 		 1060 aa  1460    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  70.71 
 
 		 1065 aa  1496    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  51.39 
 
 		 1046 aa  1058    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  53.17 
 
 		 1045 aa  1117    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  67.44 
 
 		 1060 aa  1443    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  35.79 
 
 		 1063 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  55.49 
 
 		 1056 aa  1163    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  36.71 
 
 		 1077 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  35.58 
 
 		 1043 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  56.09 
 
 		 1055 aa  1185    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  55.56 
 
 		 1044 aa  1115    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  55.08 
 
 		 1044 aa  1119    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  55.13 
 
 		 1047 aa  1156    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.8 
 
 		 1070 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  55.27 
 
 		 1068 aa  1145    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  36.93 
 
 		 1046 aa  647    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  53.74 
 
 		 1045 aa  1100    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  69.75 
 
 		 1058 aa  1492    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>