More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6418 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  100 
 
 
405 aa  816    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  52.3 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  46.81 
 
 
369 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  44.15 
 
 
388 aa  243  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  45.34 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  43.42 
 
 
390 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  44.63 
 
 
325 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  43.18 
 
 
387 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  41.47 
 
 
389 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  38.67 
 
 
360 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  48.94 
 
 
370 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  39.02 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  38.29 
 
 
391 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  35.48 
 
 
401 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  34.33 
 
 
367 aa  170  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  31.96 
 
 
363 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  35.98 
 
 
327 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  37.3 
 
 
335 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  41.6 
 
 
388 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  41.36 
 
 
320 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  36.9 
 
 
335 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  38.11 
 
 
348 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  41.36 
 
 
332 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  41.36 
 
 
332 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  39.72 
 
 
322 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  38.86 
 
 
328 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  39.34 
 
 
323 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  39.34 
 
 
323 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  39.9 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  44.81 
 
 
352 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  34.15 
 
 
338 aa  146  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  38.71 
 
 
330 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  41.85 
 
 
328 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  35.34 
 
 
328 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  36.07 
 
 
366 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  39.05 
 
 
328 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  34.2 
 
 
355 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  37.62 
 
 
322 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  34.53 
 
 
327 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  35.71 
 
 
308 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  34.43 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  44.1 
 
 
239 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  44.37 
 
 
335 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  37.21 
 
 
336 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  36.52 
 
 
325 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  40.78 
 
 
336 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  40.96 
 
 
336 aa  138  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  32.05 
 
 
327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  32.05 
 
 
327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  31.67 
 
 
332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  34.74 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  40.29 
 
 
336 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  38.54 
 
 
336 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  40.82 
 
 
335 aa  132  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  33.79 
 
 
321 aa  132  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  40.61 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  35.57 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  35.57 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  40.2 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  40.61 
 
 
425 aa  126  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  34.21 
 
 
332 aa  126  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  39.78 
 
 
468 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  37.17 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  43.42 
 
 
428 aa  121  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  41.32 
 
 
427 aa  119  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  46.15 
 
 
493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  38.66 
 
 
477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  38.04 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  35.07 
 
 
426 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  37.3 
 
 
459 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  44.83 
 
 
425 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  36.22 
 
 
424 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  42.66 
 
 
419 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  36.69 
 
 
243 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.02 
 
 
738 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  35.21 
 
 
639 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0500  AAA family ATPase  28.4 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0781793  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.19 
 
 
604 aa  94  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  33.19 
 
 
499 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf856  cell division protein FtsH  29.02 
 
 
744 aa  92.4  1e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.19 
 
 
608 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  40.43 
 
 
613 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.49 
 
 
643 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.9 
 
 
639 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03110  hypothetical protein  34.9 
 
 
1124 aa  90.9  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.86 
 
 
648 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.99 
 
 
662 aa  90.9  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.73 
 
 
718 aa  90.9  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.62 
 
 
697 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.62 
 
 
697 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.21 
 
 
643 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.71 
 
 
659 aa  89.7  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  32.21 
 
 
632 aa  89.7  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  32.02 
 
 
426 aa  89.7  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  37.01 
 
 
642 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0297  putative cell division protein  35.25 
 
 
635 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.168134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  30.86 
 
 
681 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.33 
 
 
640 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  36.88 
 
 
776 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>