More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2020 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2020  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
521 aa  1030    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1406  methyl-accepting chemotaxis I  50.77 
 
 
608 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  50.91 
 
 
600 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.67 
 
 
615 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.67 
 
 
615 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.81 
 
 
570 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.1 
 
 
608 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319993  normal  0.0826606 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.1 
 
 
608 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.27 
 
 
514 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3678  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.15 
 
 
605 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.89 
 
 
588 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.06 
 
 
538 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205381  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2470  methyl-accepting chemotaxis protein  48.66 
 
 
616 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.68 
 
 
601 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.6 
 
 
513 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 
522 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 
522 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  47.8 
 
 
513 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5635  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.71 
 
 
519 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264146  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.52 
 
 
519 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4665  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.52 
 
 
519 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0344145  normal  0.449012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.33 
 
 
519 aa  359  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 
596 aa  359  8e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1588  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.22 
 
 
588 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834305  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.57 
 
 
612 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.445402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.39 
 
 
617 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1872  methyl-accepting chemotaxis protein  48.46 
 
 
626 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.11 
 
 
572 aa  354  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4511  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.95 
 
 
519 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2024  methyl-accepting chemotaxis protein I  48.27 
 
 
634 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 
587 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512784  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  46.87 
 
 
515 aa  352  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1859  methyl-accepting chemotaxis protein  48.08 
 
 
621 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.674726  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.72 
 
 
524 aa  349  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1131  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 
588 aa  349  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 
588 aa  349  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.542582  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1232  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 
595 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0384777  normal  0.175298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 
547 aa  347  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 
519 aa  346  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242338  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.87 
 
 
519 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.53 
 
 
542 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.128174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.55 
 
 
549 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0437284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.39 
 
 
618 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.12 
 
 
532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1358  methyl-accepting chemotaxis protein  44.9 
 
 
518 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2534  methyl-accepting chemotaxis protein  44.9 
 
 
518 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1280  methyl-accepting chemotaxis protein  44.9 
 
 
518 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 
648 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1464  methyl-accepting chemotaxis protein  44.69 
 
 
518 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.18 
 
 
597 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.19 
 
 
567 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3853  methyl-accepting chemotaxis protein II  46.82 
 
 
671 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1508  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.36 
 
 
587 aa  336  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1298  methyl-accepting chemotaxis protein  44.83 
 
 
530 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.09541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0074  methyl-accepting chemotaxis protein I  46.63 
 
 
673 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0548  methyl-accepting chemotaxis protein  44.83 
 
 
530 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0277  methyl-accepting chemotaxis protein  44.83 
 
 
530 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0171  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.7 
 
 
648 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3934  methyl-accepting chemotaxis protein  46.63 
 
 
673 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.3175  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6386  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.22 
 
 
542 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.864566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.61 
 
 
659 aa  333  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.677561 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3433  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.44 
 
 
673 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2857  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  46.44 
 
 
673 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3118  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.44 
 
 
673 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0285227  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1686  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.44 
 
 
673 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303273  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 
655 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139099  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.05 
 
 
579 aa  330  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3180  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  46.24 
 
 
666 aa  329  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.2 
 
 
535 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.45 
 
 
583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.85 
 
 
659 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0258  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.85 
 
 
659 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00414638  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.43 
 
 
584 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.82 
 
 
553 aa  325  9e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.56 
 
 
657 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0244017  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.84 
 
 
554 aa  323  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37293  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03153  putative methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  53.55 
 
 
524 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.471775  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.79 
 
 
549 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.05 
 
 
527 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.72 
 
 
589 aa  317  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  55.62 
 
 
513 aa  316  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.91 
 
 
539 aa  316  7e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.359916  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.99 
 
 
594 aa  316  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.27 
 
 
542 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.68 
 
 
558 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.33 
 
 
565 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.521693  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.33 
 
 
565 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.430546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.1 
 
 
555 aa  315  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.13 
 
 
564 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208452  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.4 
 
 
559 aa  314  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4062  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.3 
 
 
653 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.3 
 
 
653 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
516 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.024141 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 
542 aa  311  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.821346  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.31 
 
 
519 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0128017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  57.49 
 
 
551 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.84 
 
 
541 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.87 
 
 
514 aa  310  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756011  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 
519 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330697  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  50.29 
 
 
543 aa  309  8e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>