More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3824 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3824  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  276  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  79.07 
 
 		 133 aa  211  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  48.8 
 
 		 225 aa  107  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  42.52 
 
 		 256 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  46.83 
 
 		 225 aa  100  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  39.37 
 
 		 214 aa  98.6  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  37.8 
 
 		 216 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  36.22 
 
 		 223 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  39.71 
 
 		 212 aa  94  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  37.8 
 
 		 216 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  38.97 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  38.24 
 
 		 215 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  37.01 
 
 		 214 aa  90.9  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  33.59 
 
 		 220 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  32.59 
 
 		 219 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  36.22 
 
 		 210 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 215 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 215 aa  85.9  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 		 230 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  36.07 
 
 		 208 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  33.07 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  41.03 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  36.43 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  32.85 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  36.43 
 
 		 214 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  38.28 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  32.33 
 
 		 877 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  37.5 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  36.8 
 
 		 867 aa  76.6  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  32.35 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  34.92 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  32.28 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  38.58 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  34.27 
 
 		 880 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  29.13 
 
 		 219 aa  74.3  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  32.52 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  26.02 
 
 		 221 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  31.25 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  35.92 
 
 		 423 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  29.27 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  35.11 
 
 		 282 aa  70.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  30.89 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  29.13 
 
 		 210 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  36.89 
 
 		 262 aa  70.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  35.66 
 
 		 230 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.33 
 
 		 688 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  39.37 
 
 		 247 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  34.4 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  29.1 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  28.47 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  37.8 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  28.93 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  30.23 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  33.07 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.88 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  38.74 
 
 		 313 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32 
 
 		 769 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  30.53 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  30.53 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  32.8 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 432 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  33.6 
 
 		 503 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.52 
 
 		 845 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 		 208 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  38.02 
 
 		 490 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  36.64 
 
 		 246 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  34.51 
 
 		 375 aa  67.4  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  30.77 
 
 		 904 aa  67  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 		 873 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  30.47 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  30.4 
 
 		 909 aa  67  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  31.11 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  27.87 
 
 		 513 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 		 279 aa  66.6  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  30.99 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  31.62 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  32.12 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  31.2 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 		 688 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  39.09 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  31.2 
 
 		 907 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>