63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3082 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  100 
 
 		 816 aa  1635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  57.16 
 
 		 792 aa  815    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  40.19 
 
 		 882 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1476  hypothetical protein  46.5 
 
 		 247 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000317669  normal  0.706918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  29.4 
 
 		 838 aa  183  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1088 aa  174  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  28.5 
 
 		 1089 aa  141  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  24.62 
 
 		 995 aa  94.4  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1036 aa  94.4  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  31.82 
 
 		 1041 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  29.35 
 
 		 652 aa  82.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.97 
 
 		 950 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  31.1 
 
 		 974 aa  77.8  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.75 
 
 		 836 aa  77.8  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  32.93 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  28.64 
 
 		 1020 aa  72.4  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  21.27 
 
 		 1058 aa  72  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1147 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1120 aa  65.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1178 aa  65.5  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1177 aa  61.6  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  36.27 
 
 		 1159 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2384  hypothetical protein  25 
 
 		 732 aa  57.4  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1426 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  35.8 
 
 		 1194 aa  56.2  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1154 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  31.93 
 
 		 478 aa  57  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  39.24 
 
 		 1104 aa  55.8  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  41.56 
 
 		 1243 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  32.35 
 
 		 1170 aa  55.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  28.96 
 
 		 684 aa  53.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1231 aa  52.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1366 aa  52  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1497 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  32.93 
 
 		 1257 aa  51.6  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  25.7 
 
 		 746 aa  51.2  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  34.94 
 
 		 1244 aa  50.8  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  40.48 
 
 		 466 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  27.37 
 
 		 1252 aa  50.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  26.29 
 
 		 1256 aa  50.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1339 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1339 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1338 aa  48.5  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  41.27 
 
 		 410 aa  48.1  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1299 aa  48.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1440 aa  47.8  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.88 
 
 		 1134 aa  47.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1298 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1425 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  44.78 
 
 		 629 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  28.42 
 
 		 795 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1210 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  30.23 
 
 		 1432 aa  45.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  25.21 
 
 		 748 aa  45.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1359 aa  45.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  40.62 
 
 		 1132 aa  45.4  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  38.24 
 
 		 1355 aa  44.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  29.58 
 
 		 1186 aa  44.7  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  34.07 
 
 		 562 aa  44.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.47 
 
 		 1076 aa  44.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1282 aa  44.3  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  25.64 
 
 		 493 aa  44.3  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  33.75 
 
 		 1336 aa  44.3  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>