57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2574 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  100 
 
 		 3861 aa  7712    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  83.29 
 
 		 3822 aa  6299    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  26.91 
 
 		 3907 aa  432  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  26.75 
 
 		 4357 aa  413  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  26.71 
 
 		 4022 aa  238  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  28.32 
 
 		 4009 aa  236  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  35.12 
 
 		 14609 aa  85.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  37.41 
 
 		 1831 aa  76.3  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  35.56 
 
 		 692 aa  72.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1908 aa  67.8  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  37.14 
 
 		 1487 aa  65.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.95 
 
 		 3552 aa  60.1  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1316 aa  59.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  29.49 
 
 		 3824 aa  57  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  31.82 
 
 		 3721 aa  56.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  41.3 
 
 		 474 aa  56.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  27.12 
 
 		 6678 aa  56.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  31.82 
 
 		 3824 aa  56.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  42.67 
 
 		 1188 aa  55.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  37.5 
 
 		 830 aa  55.5  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  26.24 
 
 		 4761 aa  54.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  31.31 
 
 		 3824 aa  54.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  31.31 
 
 		 3739 aa  54.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  24.7 
 
 		 1096 aa  54.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  36.69 
 
 		 1394 aa  53.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  36.62 
 
 		 1263 aa  52.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.92 
 
 		 3586 aa  53.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  45.9 
 
 		 1107 aa  52.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  48.39 
 
 		 2374 aa  52  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  31.21 
 
 		 265 aa  51.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  38.55 
 
 		 2117 aa  51.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  29.52 
 
 		 5561 aa  50.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  43.55 
 
 		 3027 aa  50.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  23.11 
 
 		 307 aa  50.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.57 
 
 		 4106 aa  50.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  25.4 
 
 		 1695 aa  49.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  28.86 
 
 		 777 aa  49.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 462 aa  49.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  29.52 
 
 		 5561 aa  48.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  48.94 
 
 		 1446 aa  48.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.71 
 
 		 2927 aa  49.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0642  hypothetical protein  26.04 
 
 		 653 aa  48.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000417022  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1119  hypothetical protein  26.14 
 
 		 476 aa  48.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.993118  normal  0.376129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  27.81 
 
 		 531 aa  48.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 564 aa  48.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  25.18 
 
 		 1219 aa  48.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  42.86 
 
 		 767 aa  47.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  30 
 
 		 286 aa  47.8  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  29.2 
 
 		 5559 aa  47.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  26.52 
 
 		 499 aa  47.8  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  29.2 
 
 		 5559 aa  47.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  28.95 
 
 		 3325 aa  47.4  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  27.98 
 
 		 703 aa  47  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  29.2 
 
 		 5561 aa  47  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  43.66 
 
 		 4874 aa  46.6  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  27.8 
 
 		 5743 aa  46.6  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  39.78 
 
 		 866 aa  46.6  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>