More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1567 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 397 aa  808    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  87.88 
 
 		 397 aa  714    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  56.19 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  40.44 
 
 		 425 aa  290  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  41.26 
 
 		 463 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  41.35 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 401 aa  249  8e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  39.51 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 401 aa  243  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 416 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  40.87 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  38.48 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  36.36 
 
 		 433 aa  239  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0003  putative transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.761486  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 437 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.44 
 
 		 436 aa  236  7e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  36.1 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 383 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.51 
 
 		 517 aa  233  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 398 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  37.53 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 441 aa  232  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  38.96 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  34.6 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  33.92 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 402 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 611 aa  229  7e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  34.1 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.02 
 
 		 406 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 450 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  37.23 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 		 420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  36.51 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 441 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 432 aa  226  6e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 398 aa  226  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3001  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 520 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  33.85 
 
 		 416 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 440 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  36.48 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 404 aa  222  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 398 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  36.59 
 
 		 393 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 405 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  33.74 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  35.73 
 
 		 554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  35.37 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 413 aa  219  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 397 aa  219  5e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  39.11 
 
 		 416 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 547 aa  219  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 430 aa  219  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  36.86 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  36.86 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  38.38 
 
 		 400 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  36.59 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  34.42 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 438 aa  215  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  36.63 
 
 		 398 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  35.88 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  32.23 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  35.39 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  36.59 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  36.81 
 
 		 407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>