More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4057 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4057  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0519536  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  94.88 
 
 		 254 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4883  ABC transporter related  94.88 
 
 		 254 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  93.31 
 
 		 254 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  88.49 
 
 		 254 aa  454  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  72.05 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  71.26 
 
 		 255 aa  355  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  70.2 
 
 		 255 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  70.4 
 
 		 260 aa  339  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  64.84 
 
 		 292 aa  327  9e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.68 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.68 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  45.68 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  47.41 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  48.56 
 
 		 256 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  46.67 
 
 		 256 aa  225  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  46.67 
 
 		 256 aa  225  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  46.56 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  45.28 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  46.06 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  43.37 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  48.16 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  46.34 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  43.58 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  45.12 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  45.27 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  44.14 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  43.28 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  43.19 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  44.98 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  42.8 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  43.03 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  44.08 
 
 		 842 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  44.13 
 
 		 258 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  42.74 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  45.31 
 
 		 246 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 250 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  44.49 
 
 		 257 aa  198  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  44.44 
 
 		 278 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  42.34 
 
 		 251 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  44.94 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  44.08 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  43.72 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  42.63 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  45.6 
 
 		 859 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  42.8 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  40.65 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  43.85 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.36 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  44.13 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  44.76 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  43.5 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  43.21 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  42.51 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0017  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.63 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0938  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.21 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  45.63 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  41.63 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  42.51 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  43.03 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  45.73 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  42.51 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 250 aa  191  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  44.44 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  42.4 
 
 		 245 aa  191  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  41.63 
 
 		 263 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  42.57 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  45.53 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2135  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.95 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  43.95 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  41.53 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  44.44 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  41.77 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  43.95 
 
 		 262 aa  190  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  42.34 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  43.95 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  41.13 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0085  ABC transporter related  41.63 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  43.21 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  42.8 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  43.62 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0074  ABC transporter related  41.63 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  42.45 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  41.43 
 
 		 275 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  41.43 
 
 		 275 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  41.43 
 
 		 275 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  42.45 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  44.44 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  43.2 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>