197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1722 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  60 
 
 		 134 aa  150  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  58.46 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  58.46 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  58.46 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  56.92 
 
 		 144 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  64.49 
 
 		 144 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  58.46 
 
 		 144 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  53.54 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  57.52 
 
 		 144 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  47.9 
 
 		 133 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  48 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  46.56 
 
 		 137 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  45.24 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  44.44 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  48 
 
 		 133 aa  108  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  52 
 
 		 132 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  48.33 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  50 
 
 		 132 aa  99.8  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  44.19 
 
 		 139 aa  98.6  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  50.98 
 
 		 141 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  45.54 
 
 		 167 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  48.25 
 
 		 145 aa  94.4  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  42.5 
 
 		 133 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  51 
 
 		 140 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  51.52 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  51.52 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  51.52 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  49.45 
 
 		 149 aa  89  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  49.45 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  49.45 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  49.45 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  49.45 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  49.45 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  49.45 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  43.94 
 
 		 149 aa  88.2  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  43.75 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  37.01 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  48.04 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  49.49 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  37.69 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  47.41 
 
 		 333 aa  74.3  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  41.26 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  40.16 
 
 		 149 aa  72  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  40.65 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  39.68 
 
 		 143 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  37.88 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  34.4 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  38.35 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  38.35 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  44.55 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  44.55 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  35.43 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  39.81 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  39 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  39.81 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  42.2 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  37.69 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  38.93 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  41.51 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  38.76 
 
 		 158 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  36.22 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  36.22 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  41.46 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2088  hypothetical protein  33.86 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  38.06 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  45.54 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  33.09 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  45.54 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  35.48 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  36.3 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  37.59 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  36.51 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  39.81 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  36.64 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  32.09 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  37.21 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  37.61 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  37.21 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  36.29 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  36.29 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  41.98 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  36.19 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  38.33 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  39.6 
 
 		 336 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  32.8 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  39.6 
 
 		 336 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  39.6 
 
 		 336 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  34.69 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1588  hypothetical protein  36.67 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  44.04 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  39.6 
 
 		 336 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  41.38 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  32.86 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  31.15 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  33.08 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>