236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3604 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 331 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  87.27 
 
 		 331 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  82.87 
 
 		 329 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  75.24 
 
 		 316 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3076  aminoglycoside phosphotransferase  61.61 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422792  normal  0.609725 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3517  aminoglycoside phosphotransferase  54.77 
 
 		 334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  50.65 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2483  aminoglycoside phosphotransferase  45.69 
 
 		 323 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370489  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  40.91 
 
 		 447 aa  219  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3968  aminoglycoside phosphotransferase  44.95 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4584  aminoglycoside phosphotransferase  41.39 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  40.84 
 
 		 319 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  40.84 
 
 		 319 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  40.51 
 
 		 319 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  39.42 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5527  putative aminoglycoside phosphotransferase  38.26 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  35.63 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 		 443 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4452  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 		 346 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.744873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2791  aminoglycoside phosphotransferase  34.89 
 
 		 376 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35990  FadE36, aminoglycoside phosphotransferase  33.76 
 
 		 398 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000000000000200155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2501  aminoglycoside phosphotransferase  30.9 
 
 		 346 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  31.48 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  28.71 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  28.75 
 
 		 346 aa  99.4  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  28.8 
 
 		 370 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  24.84 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  31.66 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  26.75 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  25.43 
 
 		 354 aa  92.8  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1505  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1528  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  28.25 
 
 		 403 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  29 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  28.4 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1003  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.083137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  29.33 
 
 		 358 aa  86.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 		 343 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  25.41 
 
 		 337 aa  85.9  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2908  aminoglycoside phosphotransferase  28.28 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.1681 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  30.45 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  25.15 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  27.9 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  27.64 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  27.64 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1505  aminoglycoside phosphotransferase  30.19 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  26.57 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  28.75 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  25 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1149  aminoglycoside phosphotransferase  29.79 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0894  aminoglycoside phosphotransferase  37.42 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  24.85 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  24.46 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  27.67 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  29.43 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  27.16 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  25.45 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  27.47 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  26.63 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  30.45 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  28.48 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  30.8 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  30.27 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  30.13 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  26.85 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  26.11 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  26.2 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  26.84 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  25.61 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.96 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  24.84 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1323  phosphotransferase enzyme family protein  26.65 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2683  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  29.89 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.124499  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1805  phosphotransferase enzyme family protein  26.65 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1460  phosphotransferase family protein  26.65 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  24.69 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  27.88 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  26.36 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  28.85 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0437  phosphotransferase enzyme family protein  26.65 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  24.23 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1154  phosphotransferase enzyme family protein  26.65 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0714  phosphotransferase enzyme family protein  26.65 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1314  phosphotransferase enzyme family protein  26.65 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  24.84 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  28.08 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  27.89 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  29.39 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2010  aminoglycoside phosphotransferase  30.49 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0773583  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4307  aminoglycoside phosphotransferase  28.08 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4558  aminoglycoside phosphotransferase  26.87 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2050  aminoglycoside phosphotransferase  28.78 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44815  predicted protein  26.73 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>