299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3098 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  729    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3124  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.84 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.45434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2986  NMT1/THI5 like domain protein  30.79 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  31.69 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.73 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3175  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.21 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1170  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0662412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3168  ABC transporter, periplasmic binding protein  29.7 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3906  WD-40 repeat-containing protein  29.7 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  27.33 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  29.57 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2543  putative binding protein  27.27 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.721383 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  30.58 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  28.62 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  26.61 
 
 		 311 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.24 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  25.62 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  27.6 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.38 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  27.27 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  32.53 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  26.58 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.87 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  27.04 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  30.85 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.94 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.36 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  28.08 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  32.53 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.92 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  27.33 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.33 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  26.32 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  28.44 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.76 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  32.26 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  23.47 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  31.95 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.74 
 
 		 346 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  26.55 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.67 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.17 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  24.86 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  30.25 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  25.28 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  25.64 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.83 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  25.66 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  30.52 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.52 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  28.33 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.52 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.62 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  24.51 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2671  NMT1/THI5 like domain protein  34.15 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  29.61 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  22.52 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  29.49 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  22.11 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  27.52 
 
 		 778 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  31.15 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  28.57 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  25.21 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2673  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.74 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.22 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  29.22 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.16 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.22 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25.19 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  24.79 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  24.9 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.19 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  25.1 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  27.78 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  25.1 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  27.78 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.28 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  24.11 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.51 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  30.08 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  30.63 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.78 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  25.7 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  26.82 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  22.96 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  25.19 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3033  hypothetical protein  26.54 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233167  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  28.1 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.55 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0260  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.388479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.76 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  30.16 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>