More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1981 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  62.21 
 
 		 525 aa  678    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  63.33 
 
 		 525 aa  676    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  90.94 
 
 		 530 aa  969    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  59.2 
 
 		 532 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.83 
 
 		 529 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  66.93 
 
 		 532 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.94 
 
 		 525 aa  644    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  76.66 
 
 		 529 aa  813    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 528 aa  1064    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  82.14 
 
 		 531 aa  863    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.33 
 
 		 525 aa  676    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  63.41 
 
 		 522 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.55 
 
 		 528 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  92.44 
 
 		 528 aa  970    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  59.77 
 
 		 532 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  60.04 
 
 		 529 aa  627  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.85 
 
 		 529 aa  627  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  59.27 
 
 		 525 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.24 
 
 		 529 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.09 
 
 		 525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.1 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.43 
 
 		 536 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.54 
 
 		 524 aa  458  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  48.82 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.94 
 
 		 530 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.62 
 
 		 543 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.1 
 
 		 524 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.1 
 
 		 524 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.8 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.24 
 
 		 517 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.91 
 
 		 524 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.8 
 
 		 524 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.76 
 
 		 526 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.99 
 
 		 524 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.44 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.22 
 
 		 524 aa  428  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.27 
 
 		 516 aa  425  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.7 
 
 		 532 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  43.57 
 
 		 523 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.88 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.59 
 
 		 513 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103598 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.62 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.456892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.13 
 
 		 539 aa  339  8e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0204  putative multidrug resistance protein  39.68 
 
 		 539 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 517 aa  335  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.63 
 
 		 535 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.96 
 
 		 516 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  35.57 
 
 		 534 aa  329  7e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 		 516 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 		 516 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  36.96 
 
 		 519 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4713  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.51 
 
 		 510 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.98 
 
 		 516 aa  324  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.45 
 
 		 536 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.74 
 
 		 535 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1870  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.93 
 
 		 532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0229  multidrug efflux pump, MF superfamily  40.93 
 
 		 532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  36.71 
 
 		 499 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.04 
 
 		 535 aa  321  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.04 
 
 		 535 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.85 
 
 		 540 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.05 
 
 		 542 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.05 
 
 		 542 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.05 
 
 		 542 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.05 
 
 		 542 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.82 
 
 		 519 aa  316  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.82 
 
 		 526 aa  316  7e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  36.81 
 
 		 539 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.65 
 
 		 539 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.15 
 
 		 523 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  37.21 
 
 		 529 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  34.32 
 
 		 528 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.25 
 
 		 543 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  34.34 
 
 		 524 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.56 
 
 		 538 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.9 
 
 		 529 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.27 
 
 		 527 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.02 
 
 		 526 aa  301  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.37 
 
 		 535 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 		 523 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.25 
 
 		 532 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 		 528 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 		 528 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 		 528 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.01 
 
 		 528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.03 
 
 		 528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.01 
 
 		 529 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.03 
 
 		 528 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.45 
 
 		 521 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.59 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.63 
 
 		 516 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
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NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.49 
 
 		 526 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.05 
 
 		 515 aa  274  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.59 
 
 		 506 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.86 
 
 		 515 aa  272  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.55 
 
 		 515 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 		 517 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 516 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.73 
 
 		 527 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
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