90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1495 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1495  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  908    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6325  hypothetical protein  62.11 
 
 		 452 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4091  protein of unknown function DUF1446  59.91 
 
 		 452 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3689  protein of unknown function DUF1446  62.19 
 
 		 444 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.539292  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1346  hypothetical protein  61.28 
 
 		 461 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0886  hypothetical protein  60.62 
 
 		 461 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1368  hypothetical protein  60.62 
 
 		 461 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1271  hypothetical protein  60.13 
 
 		 453 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.11625 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1928  hypothetical protein  61.07 
 
 		 453 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0148071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4048  hypothetical protein  61.12 
 
 		 445 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.905115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4171  hypothetical protein  56.76 
 
 		 445 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6706  hypothetical protein  59.82 
 
 		 444 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0392889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4511  hypothetical protein  60.4 
 
 		 452 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1245  hypothetical protein  60.57 
 
 		 453 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5610  hypothetical protein  60.18 
 
 		 445 aa  510  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1227  hypothetical protein  54.18 
 
 		 448 aa  497  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3735  protein of unknown function DUF1446  57.02 
 
 		 451 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4812  protein of unknown function DUF1446  57.02 
 
 		 451 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1474  hypothetical protein  55.16 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3167  protein of unknown function DUF1446  53.83 
 
 		 446 aa  486  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1164  hypothetical protein  53.38 
 
 		 446 aa  482  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.301898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2673  hypothetical protein  54.42 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0708192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3292  hypothetical protein  56.21 
 
 		 452 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0825  hypothetical protein  52.36 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18500  Protein of unknown function (DUF1446)  53.81 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4147  protein of unknown function DUF1446  49.89 
 
 		 445 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0976  hypothetical protein  48.65 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0192  protein of unknown function DUF1446  48.44 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000279886  decreased coverage  0.000101954 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1939  hypothetical protein  46.74 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  1.28662e-16  normal  0.114888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3666  protein of unknown function DUF1446  51.96 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1818  hypothetical protein  46.22 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1910  protein of unknown function DUF1446  46.44 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4610  hypothetical protein  44.32 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4625  hypothetical protein  44.32 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3392  hypothetical protein  45.37 
 
 		 450 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.703348  normal  0.110524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2040  protein of unknown function DUF1446  48.44 
 
 		 473 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378243  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2111  hypothetical protein  42.92 
 
 		 451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2761  hypothetical protein  47.6 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0046084  normal  0.122953 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5398  hypothetical protein  44.35 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0713  hypothetical protein  44.97 
 
 		 482 aa  346  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17100  hypothetical protein  46.74 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5880  hypothetical protein  45.03 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0040  protein of unknown function DUF1446  39.55 
 
 		 616 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.479807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2802  hypothetical protein  36.26 
 
 		 598 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.780991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3945  hypothetical protein  37.5 
 
 		 596 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0110  protein of unknown function DUF1446  36.4 
 
 		 590 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3627  hypothetical protein  40.17 
 
 		 607 aa  237  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2689  hypothetical protein  35.97 
 
 		 612 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2268  hypothetical protein  35.86 
 
 		 600 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26750  hypothetical protein  35.41 
 
 		 600 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0103  protein of unknown function DUF1446  41.09 
 
 		 590 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0320  hypothetical protein  33.77 
 
 		 603 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4188  hypothetical protein  36.24 
 
 		 608 aa  226  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217981  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2416  hypothetical protein  35.63 
 
 		 571 aa  226  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1725  hypothetical protein  33.12 
 
 		 627 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0106987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4846  hypothetical protein  38.04 
 
 		 570 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726466  normal  0.275126 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4459  hypothetical protein  34 
 
 		 599 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6360  hypothetical protein  37.64 
 
 		 619 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00827876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4325  hypothetical protein  37.85 
 
 		 562 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2176  hypothetical protein  36.44 
 
 		 596 aa  200  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1033  protein of unknown function DUF1446  38.08 
 
 		 588 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.62804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4304  hypothetical protein  36.92 
 
 		 575 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.488796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4390  hypothetical protein  36.92 
 
 		 575 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4684  hypothetical protein  36.92 
 
 		 575 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3831  protein of unknown function DUF1446  36.92 
 
 		 587 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0438804  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16490  Protein of unknown function (DUF1446)  37.5 
 
 		 561 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0342  hypothetical protein  33.87 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4431  protein of unknown function DUF1446  35.81 
 
 		 581 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4598  hypothetical protein  37.46 
 
 		 578 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6153  protein of unknown function DUF1446  39.04 
 
 		 594 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.255067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10994  hypothetical protein  34.57 
 
 		 560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59299e-17  normal  0.631418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3206  hypothetical protein  36.39 
 
 		 574 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.136417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3217  hypothetical protein  36.39 
 
 		 574 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.784644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3268  hypothetical protein  36.39 
 
 		 574 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4765  hypothetical protein  37.3 
 
 		 562 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1885  hypothetical protein  36.19 
 
 		 578 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4555  hypothetical protein  35.21 
 
 		 584 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.655173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3231  protein of unknown function DUF1446  35.6 
 
 		 596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.113119  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10086  DUF1446 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11420)  34.47 
 
 		 587 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2826  protein of unknown function DUF1446  35.03 
 
 		 580 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.125317  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06205  conserved hypothetical protein  29.02 
 
 		 654 aa  153  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0985  hypothetical protein  28 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15420  hypothetical protein  27.19 
 
 		 461 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000364962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0486  hypothetical protein  26.48 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2577  hypothetical protein  27.72 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1720  hypothetical protein  28.14 
 
 		 464 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0538  hypothetical protein  21.69 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0918925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1876  hypothetical protein  26.61 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.189586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3213  hypothetical protein  26.89 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3993  hypothetical protein  26.48 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.627584  normal  0.0364702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>