More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3775 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 273 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  86.35 
 
 		 273 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  57.99 
 
 		 269 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  59.47 
 
 		 267 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  59.47 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  56.6 
 
 		 267 aa  330  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  52.85 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  52.26 
 
 		 267 aa  299  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  51.29 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  49.43 
 
 		 268 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  52.08 
 
 		 264 aa  285  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  50.76 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  52.81 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  52.81 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  52.81 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  48.5 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 274 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  44.91 
 
 		 269 aa  265  7e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  48.12 
 
 		 272 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  48.12 
 
 		 276 aa  258  9e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  41.22 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  40.36 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  43.5 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  40.6 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  41.57 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  40.46 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  41.47 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  26.72 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  22.99 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.72 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  25.74 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  23.83 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  26.67 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  23.99 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  26.27 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  26.27 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  26.27 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  22.5 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  25.5 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  25.29 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  22.03 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  22.48 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 340 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.66 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  22.96 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  20.47 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  25.59 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  25.78 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  24.43 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  23.25 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  22.43 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.9 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.66 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  23.13 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  22.66 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  22.71 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.71 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  22.71 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  24.31 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  21.34 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  21.18 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  24.05 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.15 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  22.71 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>