More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2731 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2947  major facilitator family transporter  93.32 
 
 		 404 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.213045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  100 
 
 		 406 aa  778    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  60.48 
 
 		 401 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  55.9 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42110  major facilitator superfamily protein  59.23 
 
 		 407 aa  381  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  56.36 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2408  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  58.57 
 
 		 413 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3349  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  58.29 
 
 		 413 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14190  General substrate transporter  61.8 
 
 		 379 aa  352  8.999999999999999e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00307  predicted 3-hydroxyphenylpropionic transporter  52.7 
 
 		 403 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3253  benzoate transport  52.7 
 
 		 403 aa  349  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00311  hypothetical protein  52.7 
 
 		 403 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3272  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  52.7 
 
 		 403 aa  349  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.834924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0428  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  52.44 
 
 		 403 aa  348  9e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0417  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  52.44 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0377  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  52.44 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0384  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  52.44 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15140  3-hydroxyphenylpropionic acid transporter  54.91 
 
 		 413 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4872  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.1 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216187  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3217  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.36 
 
 		 401 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636967  normal  0.114002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0273  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.53 
 
 		 423 aa  319  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.19 
 
 		 415 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02152  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  52.94 
 
 		 407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4540  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.13 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.328058 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.3 
 
 		 401 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.3 
 
 		 401 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2324  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  49.87 
 
 		 411 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4596  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.37 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280784  hitchhiker  0.00129913 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5633  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.37 
 
 		 401 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  decreased coverage  0.00133804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5226  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.37 
 
 		 401 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0158809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0053  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  50.87 
 
 		 401 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1099  MFS permease  44.99 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00745709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3476  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  48.04 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1070  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.09 
 
 		 430 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137947  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1798  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.09 
 
 		 430 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.371372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0833  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.09 
 
 		 430 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0632  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.09 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2364  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  51.09 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0939  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 417 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  38.14 
 
 		 441 aa  206  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  33.65 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  34.94 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  35.27 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  36.24 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 468 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  37.15 
 
 		 451 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  37 
 
 		 451 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  36.24 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  34.21 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 452 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 452 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 447 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  36.18 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  36.07 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  34.79 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  35.76 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0807  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.04 
 
 		 461 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 452 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  33.77 
 
 		 452 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 452 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 453 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 449 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 453 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  37.1 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 452 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 452 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 459 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 450 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 451 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 453 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4011  protocatechuate (4-hydroxybenzoate) transmembrane transporter  36.1 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  35.26 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 457 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 439 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 453 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 439 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  37.19 
 
 		 452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  36.27 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  31.69 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 452 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 453 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 450 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 454 aa  172  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1131  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  45.16 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  35.92 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>