More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0284 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  86.67 
 
 		 210 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  68.1 
 
 		 211 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  66.19 
 
 		 210 aa  297  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  65.71 
 
 		 210 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  65.24 
 
 		 210 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  64.29 
 
 		 210 aa  290  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  64.25 
 
 		 210 aa  284  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  62.8 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  60.87 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  60.39 
 
 		 211 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  34.72 
 
 		 219 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  41.56 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  39.29 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  34.76 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  39.44 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  40.67 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  32.24 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  32.16 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  34.68 
 
 		 216 aa  111  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  33.16 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  30.81 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  35 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  36.62 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  35.92 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  35.92 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3480  electron transport protein SCO1/SenC  33.53 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.92089  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3080  hypothetical protein  37.5 
 
 		 310 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  39.71 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  30.22 
 
 		 210 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  31.82 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  30.22 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  30.22 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  30.22 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  35.37 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3333  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  35.53 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  35.17 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  29.52 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  36.09 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  30.11 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  35.46 
 
 		 209 aa  101  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  36.57 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  37.41 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  38.13 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  37.34 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 203 aa  98.2  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7198  electron transport protein SCO1/SenC  39.72 
 
 		 247 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.325684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  36.43 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  34.62 
 
 		 205 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  29.48 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  34.84 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  35.48 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  28.87 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  36.11 
 
 		 239 aa  94.7  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 		 192 aa  94.7  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 191 aa  94.7  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  33.81 
 
 		 198 aa  94.7  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5632  electron transport protein SCO1/SenC  36.3 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.765574  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  28.35 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  35.82 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  35.97 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  33.57 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  35.46 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  36.03 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 		 246 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  32.42 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  36.67 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  34.19 
 
 		 194 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  38.81 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  34.56 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  36.73 
 
 		 226 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  33.55 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 211 aa  91.7  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  47.73 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  37.12 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  34.19 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  32.09 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  31.86 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3067  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00232769  hitchhiker  0.00529609 
 
 
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NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  36.3 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  28.14 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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