More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0543 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0543  dihydroorotase  100 
 
 		 403 aa  835    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0532  putative dihydroorotase-like protein  93.06 
 
 		 393 aa  756    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106529 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1855  dihydroorotase-like protein  78.57 
 
 		 383 aa  650    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000930966  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  43.75 
 
 		 425 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.66 
 
 		 437 aa  293  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.55 
 
 		 426 aa  292  8e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  42.39 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  39.84 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.32 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  40.55 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.3 
 
 		 431 aa  282  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  41 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  40.92 
 
 		 424 aa  281  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  40.55 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  42.39 
 
 		 423 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  39.01 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  41.55 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  39.84 
 
 		 425 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.9 
 
 		 427 aa  272  8.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  40.48 
 
 		 426 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  38.07 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.05 
 
 		 458 aa  269  8e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  40.44 
 
 		 425 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  40.21 
 
 		 425 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  41 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  41 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  41 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  39.29 
 
 		 424 aa  266  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  39.45 
 
 		 425 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  39.45 
 
 		 425 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  39.45 
 
 		 425 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  39.45 
 
 		 425 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  39.45 
 
 		 425 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  39.45 
 
 		 425 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  39.45 
 
 		 425 aa  265  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  41.11 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  39.45 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  39.61 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  39.24 
 
 		 428 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  40.72 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  40.73 
 
 		 448 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  38.96 
 
 		 425 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  40.32 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  40.06 
 
 		 426 aa  260  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.44 
 
 		 423 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  38.9 
 
 		 439 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  39.24 
 
 		 425 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  37.81 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  39.18 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  37.81 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  40.88 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  39.24 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  39.24 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  40.05 
 
 		 431 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.78 
 
 		 425 aa  255  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  39.62 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  37.91 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  39.19 
 
 		 446 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  35.77 
 
 		 422 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.15 
 
 		 425 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  37.97 
 
 		 432 aa  245  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.99 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  38.56 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  39.24 
 
 		 427 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.7 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.6 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  35.28 
 
 		 431 aa  240  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.33 
 
 		 425 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  35.71 
 
 		 426 aa  236  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.03 
 
 		 429 aa  235  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  40.05 
 
 		 439 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  38.87 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.77 
 
 		 439 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  32.14 
 
 		 425 aa  229  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  34.58 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  36.99 
 
 		 415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.33 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.36 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.43 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.62 
 
 		 434 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  33.33 
 
 		 436 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.77 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.78 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  34.53 
 
 		 432 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.15 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.08 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.29 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.6 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.33 
 
 		 434 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.78 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2965  dihydroorotase  35.9 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.51 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  34.51 
 
 		 433 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.23 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.88 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.98 
 
 		 441 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0923  amidohydrolase  33.7 
 
 		 407 aa  206  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.671663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.07 
 
 		 433 aa  206  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.55 
 
 		 430 aa  206  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.96 
 
 		 436 aa  205  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>