185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1738 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1738  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
1035 aa  2092    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.93623  normal  0.347072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0791  ComEC/Rec2-related protein  31.66 
 
 
1006 aa  350  7e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.52274  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0785  competence protein, ComEC  31.57 
 
 
986 aa  330  8e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5080  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.29 
 
 
832 aa  107  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.411729  normal  0.0251813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.03 
 
 
948 aa  94  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.83 
 
 
878 aa  90.9  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.98 
 
 
801 aa  90.1  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2476  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.28 
 
 
766 aa  87.8  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1768  hypothetical protein  25.64 
 
 
763 aa  87  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.31 
 
 
802 aa  86.3  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.39 
 
 
851 aa  85.9  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  26.34 
 
 
825 aa  85.1  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2040  hypothetical protein  25.9 
 
 
763 aa  85.1  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1429  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30 
 
 
840 aa  83.2  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.44 
 
 
747 aa  82.4  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.94 
 
 
822 aa  82.4  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.77 
 
 
835 aa  82.4  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2554  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  32.29 
 
 
846 aa  81.6  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3158  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.66 
 
 
860 aa  81.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0990853  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.93 
 
 
766 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0899  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.03 
 
 
798 aa  80.9  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383263  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2124  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.95 
 
 
860 aa  80.1  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118158  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2207  hypothetical protein  26.37 
 
 
754 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.01066  normal  0.239269 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00917  conserved inner membrane protein  27.18 
 
 
754 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.578469  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2730  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.18 
 
 
754 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00924  hypothetical protein  27.18 
 
 
754 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.630751  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2683  hypothetical protein  27.18 
 
 
754 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692344  normal  0.226957 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.7 
 
 
861 aa  78.6  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1011  hypothetical protein  26.25 
 
 
754 aa  78.6  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00460048  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1569  ComEC/Rec2-related protein  28.67 
 
 
801 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4178  DNA internalization-like competence protein ComEC/Rec2  28.53 
 
 
747 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145225  normal  0.646667 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1074  hypothetical protein  27.03 
 
 
754 aa  75.1  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.361238  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2564  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.77 
 
 
929 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0267783  normal  0.0941772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1079  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.64 
 
 
800 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.15 
 
 
778 aa  72.8  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1711  hypothetical protein  26.57 
 
 
737 aa  73.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0805358  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1336  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.22 
 
 
765 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.62013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2608  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.83 
 
 
833 aa  72.8  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1022  recombination protein 2  28.85 
 
 
808 aa  72.4  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.949854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1779  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.49 
 
 
762 aa  71.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1059  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.56 
 
 
839 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2310  hypothetical protein  26.88 
 
 
793 aa  71.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0989  hypothetical protein  27.78 
 
 
737 aa  68.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2209  hypothetical protein  26.55 
 
 
747 aa  68.6  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.785174  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1958  hypothetical protein  25.68 
 
 
763 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0001218  normal  0.195131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2666  hypothetical protein  25.68 
 
 
763 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1097  hypothetical protein  27.78 
 
 
756 aa  67.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2581  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.98 
 
 
856 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2636  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.98 
 
 
856 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0667077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2578  hypothetical protein  25.68 
 
 
763 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0251432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1693  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.98 
 
 
842 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.891985  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2715  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.98 
 
 
842 aa  67  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.19 
 
 
845 aa  67  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2198  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.98 
 
 
856 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3120  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.98 
 
 
856 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1471  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.98 
 
 
856 aa  67  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.300879  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  26.91 
 
 
735 aa  66.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1473  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.17 
 
 
738 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  23.99 
 
 
604 aa  65.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0132  ComEC/Rec2-related protein  27.27 
 
 
979 aa  65.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.807661  normal  0.0603201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0963  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.58 
 
 
840 aa  65.1  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116554  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1120  putative transporter DNA uptake transmembrane protein  30.71 
 
 
847 aa  65.1  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.511509 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  23.26 
 
 
720 aa  64.3  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1048  hypothetical protein  27.25 
 
 
737 aa  64.3  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.486822 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  28.45 
 
 
735 aa  63.9  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.18 
 
 
784 aa  64.3  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.63 
 
 
841 aa  64.3  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00591  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.17 
 
 
776 aa  63.9  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0903265  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  27.82 
 
 
718 aa  62.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1081  hypothetical protein  26.98 
 
 
737 aa  63.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.0474337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2177  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.13 
 
 
740 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1897  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.78 
 
 
737 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1016  hypothetical protein  26.98 
 
 
737 aa  62.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.619127  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  25.14 
 
 
719 aa  62.4  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1432  hypothetical protein  27.06 
 
 
754 aa  62.4  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0687894  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3817  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.33 
 
 
738 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925349  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  25.55 
 
 
752 aa  62  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1556  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.09 
 
 
774 aa  62  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003988  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  25.6 
 
 
752 aa  62  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14730  DNA internalization-related competence protein ComA  29 
 
 
711 aa  61.6  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0603479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1443  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.59 
 
 
843 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.53 
 
 
780 aa  61.6  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0644  ComEC/Rec2-related protein  30.29 
 
 
700 aa  61.2  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.851772  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01534  hypothetical protein  25.51 
 
 
752 aa  61.2  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0484  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.29 
 
 
736 aa  61.2  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0736  putative competence-related protein  28.12 
 
 
768 aa  61.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3848  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.14 
 
 
738 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1890  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.94 
 
 
845 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2585  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.57 
 
 
773 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0547  ComEC/Rec2-related protein  29.97 
 
 
900 aa  60.1  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.13 
 
 
812 aa  60.1  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.67 
 
 
759 aa  60.1  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.06 
 
 
799 aa  59.7  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  27.76 
 
 
672 aa  59.3  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2423  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.85 
 
 
773 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25480  putative competence protein  33.12 
 
 
741 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.82 
 
 
840 aa  58.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1632  ComEC/Rec2-related protein:DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.54 
 
 
738 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1508  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.43 
 
 
737 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.09 
 
 
795 aa  58.2  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>