289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1427 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
109 aa  229  8.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0680  TraR/DksA family transcriptional regulator  67.59 
 
 
109 aa  161  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0997736  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.94 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  60 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.66 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  39.8 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.08 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.2 
 
 
269 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.19 
 
 
253 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1430  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.24 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  34.26 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.28 
 
 
228 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.79 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0744  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.43 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.186685  normal  0.0218217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.38 
 
 
121 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.82 
 
 
212 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1803  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.53 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488445  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  34.55 
 
 
236 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  41.67 
 
 
243 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40860  hypothetical protein  32.08 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.802206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  41.67 
 
 
243 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.62 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.45 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0916  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.02 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354828  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.19 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  40.28 
 
 
243 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  40.28 
 
 
243 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  40.28 
 
 
243 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.38 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  40.28 
 
 
243 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1198  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.46 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114031  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.28 
 
 
243 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1511  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.66 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  36.36 
 
 
283 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1800  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.7 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  32.29 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.25 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0166  DnaK suppressor protein  28.7 
 
 
105 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.78 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  34.41 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.45 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1886  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.06 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271081  decreased coverage  0.00232468 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.06 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577167  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.26 
 
 
212 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  38.89 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  38.89 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  38.89 
 
 
243 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.85 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.85 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.85 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1990  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.18 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.4478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.89 
 
 
243 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1282  zinc finger DksA/TraR C4-type  29.63 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  51.22 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.85 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0524  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.18 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.78 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1772  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.18 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000102348  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  35.29 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  34.74 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.3 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0424  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.18 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00014325  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.38 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.29 
 
 
138 aa  52  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.67 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.14 
 
 
118 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.14 
 
 
118 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.29 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2286  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.91 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000387566  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.61 
 
 
150 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  34.09 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  36 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  31.86 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.36 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.08 
 
 
113 aa  51.2  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1477  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.7 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  37.04 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.63 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0167  putative DnaK suppressor  30.77 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000243735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1977  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.99 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.02 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.76 
 
 
234 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  36.84 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.68 
 
 
144 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.84 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0964  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.67 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.633657  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0429  hypothetical protein  47.83 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0238  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.61 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.68 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  35 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.68 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.35 
 
 
138 aa  50.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.24 
 
 
216 aa  50.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.7 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2047  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.33 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.78 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 
206 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>