110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1702 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  98.61 
 
 		 287 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  96.18 
 
 		 262 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  91.22 
 
 		 262 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  73.95 
 
 		 268 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  73.86 
 
 		 270 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  74.43 
 
 		 267 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  72.62 
 
 		 270 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  73.75 
 
 		 269 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  73.75 
 
 		 269 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  39.53 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  39.15 
 
 		 261 aa  202  7e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  40.47 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  41.15 
 
 		 267 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  41.38 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  41 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  41 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 267 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  41.92 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  40.61 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  40.61 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  40.61 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  40.61 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  40.61 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  40.47 
 
 		 309 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  40.15 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 273 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  39.08 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  38.7 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  39.08 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  38.7 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  38.7 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  38.7 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  39.53 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  40 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  39.23 
 
 		 264 aa  175  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  33.46 
 
 		 267 aa  172  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  36.4 
 
 		 280 aa  158  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  30.66 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  34.77 
 
 		 289 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  31.36 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  35.55 
 
 		 283 aa  142  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  32.54 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  32.26 
 
 		 269 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  31.54 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 289 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  24.61 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  26.54 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  26.54 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  26.11 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  28.27 
 
 		 444 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  33.33 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  24.58 
 
 		 418 aa  48.9  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  31.54 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  22.82 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 352 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  22.69 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.32 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  25.09 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  24.8 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  25.88 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  32.29 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>