167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2655 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 223 aa  446  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  82.41 
 
 		 219 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  81.02 
 
 		 219 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  77.31 
 
 		 232 aa  332  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  53.77 
 
 		 219 aa  221  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.7 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  53.24 
 
 		 217 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  49.77 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  49.77 
 
 		 218 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  50.94 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  47.25 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  46.67 
 
 		 270 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  39.82 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  42.48 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  40.61 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  38.4 
 
 		 255 aa  124  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  42.27 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 		 273 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  38.24 
 
 		 708 aa  95.5  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 		 247 aa  92.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  35.18 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  35.75 
 
 		 321 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.9 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 364 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  31.43 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  31 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  31 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  31 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 522 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  31 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.18 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 418 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.25 
 
 		 1148 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  29.21 
 
 		 481 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  38.64 
 
 		 393 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.92 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  28.35 
 
 		 376 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 		 477 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 315 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  21.89 
 
 		 312 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 322 aa  52  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  28.72 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  34.13 
 
 		 749 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2760  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  45.61 
 
 		 403 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 		 384 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.29 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 284 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 		 386 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3138  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 		 386 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 		 349 aa  48.5  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 346 aa  48.5  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 327 aa  48.5  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 		 238 aa  48.5  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  26.85 
 
 		 1173 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 337 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  26.72 
 
 		 694 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 338 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  20.87 
 
 		 379 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 		 433 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 		 276 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 386 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  24.07 
 
 		 326 aa  47  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.8 
 
 		 1168 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 290 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 		 357 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  40.35 
 
 		 393 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 		 433 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 403 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.61 
 
 		 305 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  30.69 
 
 		 354 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>