More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2143 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
273 aa  567  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  95.97 
 
 
273 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  96.34 
 
 
273 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  94.87 
 
 
273 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  81.25 
 
 
280 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  81.11 
 
 
277 aa  470  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  80.51 
 
 
288 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  74.72 
 
 
269 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  74.44 
 
 
303 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  70.57 
 
 
286 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  71.64 
 
 
284 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  63.24 
 
 
279 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  63.02 
 
 
285 aa  355  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  59.71 
 
 
277 aa  348  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  59.34 
 
 
277 aa  346  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  55.88 
 
 
277 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  56.98 
 
 
279 aa  328  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  57.74 
 
 
281 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  55.51 
 
 
274 aa  324  8.000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  55.72 
 
 
298 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  57.58 
 
 
286 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  56.55 
 
 
282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  56.55 
 
 
281 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  56.23 
 
 
274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  52.21 
 
 
279 aa  299  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  53.58 
 
 
276 aa  295  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  52.09 
 
 
281 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  52.27 
 
 
277 aa  288  6e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  50.38 
 
 
269 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  47.91 
 
 
280 aa  276  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  48.89 
 
 
284 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  51.69 
 
 
279 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  48.85 
 
 
273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  49.43 
 
 
275 aa  262  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  46.67 
 
 
285 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  48.68 
 
 
269 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  47.23 
 
 
285 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  47.58 
 
 
285 aa  258  9e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  46.47 
 
 
285 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  46.67 
 
 
285 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  46.67 
 
 
285 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  46.67 
 
 
285 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  49.62 
 
 
280 aa  255  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  46.67 
 
 
285 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  47.21 
 
 
285 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  46.3 
 
 
285 aa  254  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  46.99 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  46.04 
 
 
274 aa  251  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  47.86 
 
 
277 aa  247  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  48.81 
 
 
277 aa  245  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  46.42 
 
 
269 aa  242  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  43.75 
 
 
274 aa  228  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  44.15 
 
 
275 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  45.63 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  39.54 
 
 
271 aa  208  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  36.02 
 
 
565 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  35.69 
 
 
369 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  36.6 
 
 
1010 aa  145  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  34.46 
 
 
980 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2021  MCP methyltransferase, CheR-type  35.44 
 
 
256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  36.36 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000593357  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.6 
 
 
1218 aa  135  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.33 
 
 
1348 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1028  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.09 
 
 
1248 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0809  MCP methyltransferase, CheR-type  31.3 
 
 
269 aa  132  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.38 
 
 
1306 aa  132  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  34.23 
 
 
1027 aa  132  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.96 
 
 
1408 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1104  protein-glutamate O-methyltransferase  33.62 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.849239  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.08 
 
 
1163 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3212  MCP methyltransferase, CheR-type  34.33 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409906  hitchhiker  0.0000000000690371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  32.47 
 
 
837 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.48 
 
 
1061 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.31 
 
 
1453 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.13 
 
 
1324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  31.27 
 
 
853 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  35.47 
 
 
1006 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.14 
 
 
1535 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  33.83 
 
 
1378 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  33.33 
 
 
1303 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  32.17 
 
 
1160 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03023  methyltransferase  32.71 
 
 
604 aa  125  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361036  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.44 
 
 
1190 aa  125  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.7 
 
 
1698 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.56 
 
 
993 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.06 
 
 
1380 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  31.29 
 
 
1483 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  34.44 
 
 
1092 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1609  protein-glutamate O-methyltransferase  31.8 
 
 
259 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00317018  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  32.06 
 
 
868 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0695  protein-glutamate O-methyltransferase  33.05 
 
 
259 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0227  MCP methyltransferase  29.68 
 
 
631 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.993793  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  33.46 
 
 
1384 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
1279 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 
1008 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
1344 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2384  protein-glutamate O-methyltransferase  32.07 
 
 
256 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.21 
 
 
1407 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0983  chemotaxis protein methyltransferase  33.86 
 
 
302 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.34 
 
 
1242 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>