49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1822 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  59.48 
 
 		 234 aa  263  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  60.61 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  53.98 
 
 		 234 aa  244  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  54.22 
 
 		 243 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  52.4 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  49.36 
 
 		 234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  51.29 
 
 		 236 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  48.5 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  46.15 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  50.67 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  44.54 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  44.4 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  43.53 
 
 		 235 aa  178  8e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  47.37 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  39.39 
 
 		 550 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  38.53 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  37.83 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  38.16 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  42.33 
 
 		 243 aa  141  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  26.4 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  28.7 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  25.3 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  24.79 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  24 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  26.14 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  34.45 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  25 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  23.46 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  26.26 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  24.67 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  30.43 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  27.4 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  25.21 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  29.35 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  29.35 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  29.02 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  28.28 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  25.97 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  26.47 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  26.87 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  25.52 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  33.63 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  31.91 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  27.59 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  31.09 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  24.24 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  29.36 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  26.24 
 
 		 233 aa  42  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>