237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1721 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0317  protein of unknown function DUF112 transmembrane  74.95 
 
 		 503 aa  699    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  78.2 
 
 		 500 aa  814    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  80.8 
 
 		 500 aa  816    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  80.2 
 
 		 500 aa  805    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  79.8 
 
 		 500 aa  784    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  65.34 
 
 		 505 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  95 
 
 		 500 aa  902    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  81 
 
 		 500 aa  820    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3212  hypothetical protein  71.91 
 
 		 504 aa  688    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  65.67 
 
 		 505 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  73.96 
 
 		 503 aa  746    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  74.35 
 
 		 504 aa  702    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1251  protein of unknown function DUF112 transmembrane  74.75 
 
 		 503 aa  709    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  64.74 
 
 		 504 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  72.37 
 
 		 506 aa  715    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  80.6 
 
 		 500 aa  814    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  81.2 
 
 		 500 aa  820    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  67.13 
 
 		 499 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2304  hypothetical protein  70.97 
 
 		 504 aa  692    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  81 
 
 		 500 aa  818    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  987    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  68.6 
 
 		 500 aa  639    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  64.54 
 
 		 504 aa  669    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  74.35 
 
 		 503 aa  737    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  75.35 
 
 		 503 aa  727    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  73.96 
 
 		 503 aa  714    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  74.55 
 
 		 503 aa  740    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4018  hypothetical protein  73.96 
 
 		 503 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391366  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  73.8 
 
 		 502 aa  709    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  63.87 
 
 		 503 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  64.4 
 
 		 501 aa  631  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  64.2 
 
 		 501 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  62 
 
 		 502 aa  625  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  61.85 
 
 		 501 aa  622  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  61.85 
 
 		 501 aa  623  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  63.8 
 
 		 501 aa  621  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  65.87 
 
 		 502 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  58.8 
 
 		 500 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  60 
 
 		 502 aa  608  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  60.49 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21270  hypothetical protein  62.8 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0553  hypothetical protein  60.64 
 
 		 500 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2248  hypothetical protein  61.85 
 
 		 500 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1625  protein of unknown function DUF112 transmembrane  61.65 
 
 		 500 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1698  protein of unknown function DUF112 transmembrane  61.65 
 
 		 500 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0701763  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6020  protein of unknown function DUF112 transmembrane  54.95 
 
 		 506 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0415  hypothetical protein  56.57 
 
 		 505 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  53.96 
 
 		 507 aa  537  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3272  hypothetical protein  53.63 
 
 		 505 aa  532  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47915  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  52.46 
 
 		 496 aa  501  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2918  hypothetical protein  50.3 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.191157  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1016  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  50.84 
 
 		 515 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2145  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  46.8 
 
 		 519 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.55 
 
 		 536 aa  465  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5653  hypothetical protein  47.75 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0296187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.49 
 
 		 519 aa  463  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1908  hypothetical protein  48.23 
 
 		 529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.839704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  49.57 
 
 		 536 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2388  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.53 
 
 		 504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  47.38 
 
 		 503 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2514  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family protein TctA  46.14 
 
 		 531 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.5 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3222  hypothetical protein  48.24 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  45.6 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  45.4 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  46.3 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3087  integral membrane protein  43.17 
 
 		 504 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2967  tricarboxylic transport  42.97 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0170848 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2984  integral membrane protein  43.17 
 
 		 504 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2932  integral membrane protein  43.17 
 
 		 504 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.171926  normal  0.136163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2900  integral membrane protein  43.17 
 
 		 504 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  48.52 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.99 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  43.78 
 
 		 509 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  47.03 
 
 		 495 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  45.38 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.74 
 
 		 500 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3433  hypothetical protein  42.26 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.15879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.84 
 
 		 502 aa  395  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3344  hypothetical protein  44.49 
 
 		 505 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  48.37 
 
 		 511 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3097  hypothetical protein  42.26 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  42.66 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0937  hypothetical protein  42.26 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  46.26 
 
 		 505 aa  395  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  46.71 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0927  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.26 
 
 		 506 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2011  hypothetical protein  44.58 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0903  hypothetical protein  42.26 
 
 		 506 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  47.01 
 
 		 512 aa  392  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.32 
 
 		 504 aa  392  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  46.03 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  43.78 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.77 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  45.68 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.19 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4234  membrane protein TctA, putative  41.77 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  45.34 
 
 		 505 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  45.36 
 
 		 505 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  44.06 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>