More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1779 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1779  SMF family protein  100 
 
 		 161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  62.26 
 
 		 229 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  47.68 
 
 		 363 aa  154  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  53.9 
 
 		 379 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  53.85 
 
 		 401 aa  147  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  53.64 
 
 		 592 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  54.67 
 
 		 365 aa  145  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  51.92 
 
 		 405 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  54 
 
 		 379 aa  144  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  54.67 
 
 		 365 aa  145  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  51.66 
 
 		 402 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  51.66 
 
 		 401 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  49.37 
 
 		 336 aa  142  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  50.66 
 
 		 375 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  51.66 
 
 		 388 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  49.34 
 
 		 394 aa  142  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  52.94 
 
 		 374 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  48.72 
 
 		 358 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  52.6 
 
 		 421 aa  141  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  50.93 
 
 		 408 aa  140  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  52.67 
 
 		 399 aa  140  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  52.94 
 
 		 399 aa  140  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  50.33 
 
 		 359 aa  140  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  53.95 
 
 		 380 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  51.57 
 
 		 386 aa  140  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  51.92 
 
 		 320 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  49.32 
 
 		 359 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  51.97 
 
 		 422 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 386 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  51.68 
 
 		 389 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  47.5 
 
 		 366 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  50.98 
 
 		 409 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  49.38 
 
 		 434 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  49.66 
 
 		 356 aa  138  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  49.33 
 
 		 361 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  53.9 
 
 		 371 aa  138  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  51.97 
 
 		 380 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  49.33 
 
 		 361 aa  137  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  50.63 
 
 		 372 aa  137  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  48.67 
 
 		 359 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  50.34 
 
 		 338 aa  137  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  49.69 
 
 		 396 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  49.69 
 
 		 434 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  49.69 
 
 		 396 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  53.29 
 
 		 422 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  50.97 
 
 		 375 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 434 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  51.37 
 
 		 340 aa  137  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  49.69 
 
 		 434 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  53.29 
 
 		 475 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  49.69 
 
 		 434 aa  137  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  48.39 
 
 		 389 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  49.04 
 
 		 338 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  49.04 
 
 		 338 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  49.04 
 
 		 338 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  49.06 
 
 		 362 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  47.74 
 
 		 364 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  46.31 
 
 		 349 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  53.33 
 
 		 448 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  50 
 
 		 433 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  52.35 
 
 		 382 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  51.63 
 
 		 382 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  52.05 
 
 		 338 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  52.63 
 
 		 475 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  52.05 
 
 		 338 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  51.97 
 
 		 422 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  46.1 
 
 		 370 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  52.05 
 
 		 338 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  52.05 
 
 		 338 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  48.39 
 
 		 374 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  48.39 
 
 		 374 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  48.39 
 
 		 374 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  48.39 
 
 		 374 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  49.32 
 
 		 294 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  52 
 
 		 422 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  52.98 
 
 		 383 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  45.81 
 
 		 362 aa  134  7.000000000000001e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  50.32 
 
 		 369 aa  134  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  50.68 
 
 		 365 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  49.66 
 
 		 393 aa  133  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  48.39 
 
 		 374 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  47.74 
 
 		 399 aa  133  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  46.95 
 
 		 377 aa  133  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  46.1 
 
 		 373 aa  132  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03136  hypothetical protein  48.37 
 
 		 374 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0428  DNA protecting protein DprA  48.37 
 
 		 374 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  48.37 
 
 		 374 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  47.77 
 
 		 352 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  48.32 
 
 		 361 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3479  DNA protecting protein DprA  48.37 
 
 		 374 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000661668  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.91 
 
 		 362 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0428  DNA protecting protein DprA  48.37 
 
 		 374 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0030328  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  45.95 
 
 		 282 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  49.37 
 
 		 372 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3788  DNA protecting protein DprA  48.15 
 
 		 373 aa  131  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00493314  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  49.69 
 
 		 372 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2377  DNA protecting protein DprA  42.59 
 
 		 421 aa  131  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  48.37 
 
 		 379 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  50 
 
 		 365 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  46.25 
 
 		 375 aa  131  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>