79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0568 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 60 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.33 
 
 		 231 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65 
 
 		 234 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.67 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.946732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0928  ABC-type transport system, permease subunit  58.49 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.33 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.68 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.04 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.753761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.5 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0466  hypothetical protein  64.44 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.700584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2223  putative permease component of ABC transporter  90.62 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.36 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.89872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2781  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0123  ABC transporter, permease protein  60.87 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.749352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.829623  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0203  ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0233  ABC transporter, permease protein  58.7 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2631  transmembrane ABC transporter protein  68.42 
 
 		 235 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  0.493142 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.29 
 
 		 242 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8915  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1813  putative permease component of ABC transporter  89.29 
 
 		 238 aa  52.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00043828 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.29 
 
 		 245 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.682243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.87 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.669819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 		 228 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.32 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.105994  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1524  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  54.17 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1710  tungstate ABC transporter, permease protein, putative  54.17 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.506083  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.12 
 
 		 230 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.931122 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1891  putative tungstate ABC transporter, permease protein  54.17 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0626  basic organic compound ABC-transporter  65.45 
 
 		 228 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.7 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.83 
 
 		 231 aa  51.2  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0915654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.94 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27150  ABC-type tungstate transport system, periplasmic component  46.43 
 
 		 248 aa  50.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.544705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.46 
 
 		 241 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.17 
 
 		 234 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00042229  normal  0.158089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.65 
 
 		 235 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003505  ABC-type tungstate transport system permease protein  55.32 
 
 		 232 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.65 
 
 		 235 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.455343  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0825  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 		 210 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00592133  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.34 
 
 		 232 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02263  hypothetical protein  47.46 
 
 		 232 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60 
 
 		 232 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.77 
 
 		 257 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.06 
 
 		 209 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.9 
 
 		 233 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 		 232 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.819313  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52 
 
 		 238 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.77 
 
 		 241 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.77 
 
 		 254 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0068  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.28 
 
 		 245 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0463742  normal  0.217149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.89 
 
 		 231 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.5 
 
 		 260 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2781  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.74 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2701  ABC transporter, permease protein  58.7 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.62 
 
 		 235 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0086  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.62 
 
 		 235 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.94 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1131  ABC transporter, permease protein  44.07 
 
 		 232 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.62 
 
 		 235 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.23 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.5 
 
 		 230 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000259316  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 		 218 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0186248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4039  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50 
 
 		 250 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 232 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.37 
 
 		 235 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.37 
 
 		 235 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.37 
 
 		 235 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.37 
 
 		 235 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.37 
 
 		 235 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.37 
 
 		 235 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.37 
 
 		 235 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4720  ABC transporter, permease protein  70.37 
 
 		 235 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  66.67 
 
 		 228 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000111264  hitchhiker  0.0000000335509 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.37 
 
 		 235 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 		 238 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.202188  normal  0.0740354 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.37 
 
 		 235 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>