140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1357 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  86.45 
 
 		 289 aa  477  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  71.17 
 
 		 270 aa  384  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  71.32 
 
 		 269 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  64.84 
 
 		 271 aa  360  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  64.84 
 
 		 271 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  62.5 
 
 		 286 aa  352  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  64.29 
 
 		 275 aa  349  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  52.03 
 
 		 280 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  49.64 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  49.28 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  49.28 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  49.28 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  49.64 
 
 		 281 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  49.64 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  49.82 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  49.82 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  49.45 
 
 		 275 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  49.45 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  49.45 
 
 		 275 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  49.45 
 
 		 275 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  49.45 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  49.45 
 
 		 275 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  49.81 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  48.01 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  48.52 
 
 		 267 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  44.6 
 
 		 273 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  43.88 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  43.73 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  47.08 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  40.93 
 
 		 273 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  41.37 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  33.71 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  33.71 
 
 		 261 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  36.7 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  36.74 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  35.47 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  35.61 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  34.83 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  35.61 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 		 261 aa  145  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  35.98 
 
 		 262 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  36.15 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 268 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  31.39 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  31.88 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  29.54 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  28.83 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  30.25 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  25.55 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  26.74 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  26.35 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  34.41 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  22.59 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  25.63 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  24.91 
 
 		 320 aa  52.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  32.11 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  30.2 
 
 		 306 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  24.62 
 
 		 444 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  31.52 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.98 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  31.3 
 
 		 456 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 315 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.95 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.77 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 274 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  22.55 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 300 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 274 aa  45.8  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0084  PHA synthase subunit PhaC  45.31 
 
 		 356 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  28.05 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>