73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4154 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  76.23 
 
 		 655 aa  1009    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  100 
 
 		 660 aa  1345    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  75.77 
 
 		 655 aa  1005    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  47 
 
 		 654 aa  599  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  37.6 
 
 		 652 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  37.52 
 
 		 648 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  35.35 
 
 		 652 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  34.93 
 
 		 654 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  34.42 
 
 		 651 aa  357  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  35.52 
 
 		 649 aa  355  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  34.03 
 
 		 672 aa  354  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  32.74 
 
 		 648 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  32.21 
 
 		 662 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  32.52 
 
 		 648 aa  343  8e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  34.02 
 
 		 659 aa  325  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  43.08 
 
 		 658 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  34.26 
 
 		 660 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  34.26 
 
 		 660 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  33.68 
 
 		 659 aa  312  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  31.57 
 
 		 653 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  31.14 
 
 		 672 aa  307  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  34.4 
 
 		 655 aa  299  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  31.81 
 
 		 659 aa  296  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  31.81 
 
 		 659 aa  296  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  33.58 
 
 		 675 aa  276  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  33.95 
 
 		 709 aa  273  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  25.37 
 
 		 605 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  28.72 
 
 		 506 aa  70.9  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  24.7 
 
 		 614 aa  67.4  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  21.45 
 
 		 614 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  21.45 
 
 		 614 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  22.57 
 
 		 588 aa  60.5  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  21.88 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  22.45 
 
 		 1249 aa  55.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  32.47 
 
 		 583 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  25.18 
 
 		 407 aa  52.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1219 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1219 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1219 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1219 aa  52  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  21.43 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  21.43 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  32.23 
 
 		 632 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  22.71 
 
 		 620 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  22.22 
 
 		 952 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  23.96 
 
 		 814 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  20.87 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  20.24 
 
 		 1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  23.3 
 
 		 719 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5964  hypothetical protein  30.39 
 
 		 641 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285067  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  31.43 
 
 		 693 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2361  GTP-binding protein EngA  29.6 
 
 		 488 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.596104  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1120  GTP-binding protein EngA  31.01 
 
 		 488 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  22.41 
 
 		 1228 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  27.22 
 
 		 585 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4065  glycine dehydrogenase  32.04 
 
 		 1072 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  29.37 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  21.37 
 
 		 666 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  29.37 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  29.37 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  29.37 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2986  GTP-binding protein EngA  27.78 
 
 		 488 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1377  GTP-binding protein EngA  27.78 
 
 		 488 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.694687  normal  0.70956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3144  GTP-binding protein EngA  27.78 
 
 		 488 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0749903 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3001  GTP-binding protein EngA  27.78 
 
 		 488 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  30.3 
 
 		 488 aa  44.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1260  GTP-binding protein EngA  30.23 
 
 		 491 aa  44.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00475437  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  22.07 
 
 		 615 aa  44.3  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  29.22 
 
 		 692 aa  44.3  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  33.33 
 
 		 548 aa  43.9  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>