More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0196 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  356  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  77.65 
 
 		 179 aa  291  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  290  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  77.09 
 
 		 179 aa  287  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  74.86 
 
 		 179 aa  283  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  71.51 
 
 		 180 aa  269  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  69.83 
 
 		 179 aa  263  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 177 aa  194  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  52.17 
 
 		 184 aa  187  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  50 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 182 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  48.86 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 183 aa  178  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  48.91 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 181 aa  177  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 178 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 178 aa  174  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  47.46 
 
 		 179 aa  174  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  45.51 
 
 		 179 aa  174  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  44.89 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  52.27 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  46.2 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0509  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 175 aa  170  9e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.910827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  48.89 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3493  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2617  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00663642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3761  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0024508  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0448  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.935491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1939  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0207492  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3789  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3731  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000218121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3154  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0206863  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>