More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1623 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 650 aa  1331    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.997433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0272  peptidase M41, FtsH  52.01 
 
 		 639 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.520053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  51.24 
 
 		 616 aa  585  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.39 
 
 		 617 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 		 652 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 		 636 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.85 
 
 		 676 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.84 
 
 		 616 aa  569  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.42 
 
 		 652 aa  570  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.28 
 
 		 633 aa  569  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 		 621 aa  571  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  54.07 
 
 		 652 aa  568  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  50.42 
 
 		 617 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  50.25 
 
 		 614 aa  568  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 		 637 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.33 
 
 		 616 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  49.42 
 
 		 646 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  54.18 
 
 		 662 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  50.08 
 
 		 608 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  49.59 
 
 		 619 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  48.85 
 
 		 637 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.14 
 
 		 639 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  49.75 
 
 		 681 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.4 
 
 		 618 aa  560  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.74 
 
 		 671 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  50 
 
 		 665 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.02 
 
 		 623 aa  559  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 		 641 aa  555  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 		 641 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  49.59 
 
 		 641 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.93 
 
 		 659 aa  554  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.02 
 
 		 612 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.4 
 
 		 615 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.3 
 
 		 640 aa  552  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 		 656 aa  554  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.53 
 
 		 647 aa  552  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.86 
 
 		 612 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  48.26 
 
 		 644 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.26 
 
 		 647 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  48.26 
 
 		 644 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  48.26 
 
 		 647 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 634 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.02 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  48.26 
 
 		 647 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  48.1 
 
 		 647 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  48.26 
 
 		 647 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.03 
 
 		 642 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 		 643 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  48.1 
 
 		 647 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  48.26 
 
 		 647 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  48.26 
 
 		 644 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  48.26 
 
 		 644 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  48.1 
 
 		 647 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.37 
 
 		 637 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.03 
 
 		 642 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  47.85 
 
 		 638 aa  547  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.84 
 
 		 617 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  48.28 
 
 		 634 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.03 
 
 		 643 aa  547  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  48.1 
 
 		 647 aa  547  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.37 
 
 		 634 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.03 
 
 		 642 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 		 635 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.46 
 
 		 652 aa  548  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  49.17 
 
 		 635 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.2 
 
 		 634 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.2 
 
 		 640 aa  547  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  47.93 
 
 		 647 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 		 648 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.41 
 
 		 647 aa  546  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.2 
 
 		 637 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  53.76 
 
 		 627 aa  546  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.58 
 
 		 635 aa  548  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  48.2 
 
 		 612 aa  547  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 		 635 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.61 
 
 		 660 aa  545  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.11 
 
 		 673 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.03 
 
 		 646 aa  545  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.04 
 
 		 643 aa  544  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  48.12 
 
 		 634 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.38 
 
 		 640 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.53 
 
 		 635 aa  544  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  47.47 
 
 		 631 aa  544  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.86 
 
 		 650 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.05 
 
 		 641 aa  542  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.08 
 
 		 620 aa  544  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  49.02 
 
 		 642 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.03 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  49.02 
 
 		 639 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.7 
 
 		 637 aa  545  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.41 
 
 		 646 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.52 
 
 		 640 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  48.37 
 
 		 641 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.27 
 
 		 650 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.88 
 
 		 634 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  47.27 
 
 		 643 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  50.17 
 
 		 649 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.4 
 
 		 640 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.59 
 
 		 639 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  56.77 
 
 		 633 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>