More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3484 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  70.63 
 
 		 257 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  63.86 
 
 		 252 aa  328  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  65.48 
 
 		 252 aa  326  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  65.18 
 
 		 257 aa  325  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  63.16 
 
 		 248 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  58.56 
 
 		 263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  62.75 
 
 		 248 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  62.75 
 
 		 248 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  60.24 
 
 		 261 aa  311  9e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  58 
 
 		 256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  58.94 
 
 		 260 aa  305  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  60.57 
 
 		 245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  55.79 
 
 		 245 aa  275  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  51.42 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  50.4 
 
 		 249 aa  248  8e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  47.33 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  46.85 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  51.24 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  48.58 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  46.96 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  46.25 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  46.67 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  44.49 
 
 		 250 aa  222  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3808  ABC transporter related  43.46 
 
 		 262 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.140241  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  43.73 
 
 		 260 aa  221  9e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  47.26 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  46.84 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  46.56 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  44.13 
 
 		 268 aa  215  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  43.75 
 
 		 261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  42.15 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2065  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4315  ABC transporter related  45.38 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 363 aa  204  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  42.86 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3036  ABC transporter related  40.62 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.845975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0350  ATPase  40.78 
 
 		 292 aa  199  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  42.04 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  40.32 
 
 		 333 aa  198  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  42.26 
 
 		 248 aa  198  7e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  41.49 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  42.62 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.74 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  41 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  40.08 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  42.21 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0514  ABC transporter related  41.02 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0531  ABC transporter related  41.02 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  hitchhiker  0.00910021 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  36.47 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  40.82 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  39.52 
 
 		 397 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  40.24 
 
 		 271 aa  191  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  39.58 
 
 		 333 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 421 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  42.56 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  39.66 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.41 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  40.57 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2585  ABC transporter related  38.4 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  39.68 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  40.98 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  42.56 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  41.98 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  40.74 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  42.56 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  39.52 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  39.92 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  38.55 
 
 		 378 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  37.65 
 
 		 357 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  39.06 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  37.65 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  41.35 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  37.25 
 
 		 361 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  38.82 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  41.13 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  37.25 
 
 		 361 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  38.87 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  37.5 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  42.62 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  41.91 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  38.43 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  38.43 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  40.8 
 
 		 270 aa  184  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  37.25 
 
 		 362 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  40.41 
 
 		 266 aa  184  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  38.06 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1196  ABC transporter related  40.59 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>