222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0975 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0975  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
432 aa  901    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.494831 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1044  basic membrane lipoprotein  72.06 
 
 
428 aa  674    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00211594 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1176  basic membrane lipoprotein  77.42 
 
 
430 aa  716    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0623927 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1314  basic membrane lipoprotein  78.7 
 
 
431 aa  722    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.348799  normal  0.383779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2177  basic membrane lipoprotein  41.18 
 
 
368 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1953  basic membrane lipoprotein  40.21 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0267127 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1460  basic membrane lipoprotein  38.34 
 
 
382 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.892929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2594  basic membrane lipoprotein  39.52 
 
 
362 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1794  basic membrane lipoprotein  37.43 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  0.801516 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1507  Bmp family membrane protein  40.76 
 
 
382 aa  249  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3026  basic membrane lipoprotein  37.77 
 
 
380 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1927  basic membrane lipoprotein  36.38 
 
 
382 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.940408  normal  0.0318829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0869  basic membrane lipoprotein  36.83 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0794  basic membrane lipoprotein  35.62 
 
 
380 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0638378  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0663  basic membrane lipoprotein  36.02 
 
 
364 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.888677  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2993  basic membrane lipoprotein  36.02 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3237  basic membrane lipoprotein  37.43 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0759  bmp family protein  35.22 
 
 
364 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  34.58 
 
 
381 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1902  basic membrane lipoprotein  36.12 
 
 
359 aa  229  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1288  basic membrane lipoprotein  37.84 
 
 
364 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  37.27 
 
 
385 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0673  basic membrane lipoprotein  35.79 
 
 
357 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1979  basic membrane lipoprotein  37 
 
 
385 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.919981  normal  0.873808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0216  basic membrane lipoprotein  35.97 
 
 
354 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.518023  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2299  basic membrane lipoprotein  37.07 
 
 
384 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2318  basic membrane lipoprotein  38.11 
 
 
368 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375115  normal  0.178466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1941  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  37.57 
 
 
364 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00208553  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  36.46 
 
 
380 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1490  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  37.53 
 
 
376 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0307169  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2636  basic membrane lipoprotein  37 
 
 
376 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.894025 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1406  basic membrane lipoprotein  36.89 
 
 
386 aa  223  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000211605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1923  basic membrane lipoprotein  35.52 
 
 
355 aa  223  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0526758  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3163  basic membrane lipoprotein  36.1 
 
 
387 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4187  basic membrane lipoprotein  34.16 
 
 
373 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.083899  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01800  hypothetical protein  35.42 
 
 
365 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347768  normal  0.597763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0224  hypothetical protein  34.34 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2027  basic membrane lipoprotein  34.51 
 
 
426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.073285  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1708  basic membrane lipoprotein  34.51 
 
 
426 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.918914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2148  basic membrane lipoprotein  34.7 
 
 
360 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.863295  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1106  basic membrane lipoprotein  34.43 
 
 
357 aa  210  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2443  basic membrane lipoprotein  34.93 
 
 
384 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3629  basic membrane lipoprotein  32.43 
 
 
355 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1415  basic membrane lipoprotein  34.72 
 
 
356 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218463  normal  0.0969049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1039  basic membrane lipoprotein  34.06 
 
 
383 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1060  basic membrane lipoprotein  37.2 
 
 
377 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  33.97 
 
 
388 aa  203  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1002  basic membrane lipoprotein  36.15 
 
 
377 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0928  basic membrane lipoprotein  33.69 
 
 
360 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1063  basic membrane lipoprotein  36.94 
 
 
377 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3176  basic membrane lipoprotein  35.36 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0567  bmp family protein  32.97 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  34.76 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3243  basic membrane lipoprotein  34.49 
 
 
364 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25432  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5006  basic membrane lipoprotein  33.16 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.167093  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3560  ABC transporter periplasmic-binding protein  34.49 
 
 
364 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2142  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 
385 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3900  basic membrane lipoprotein  33.86 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381277  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2169  lipoprotein  32.73 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0737964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2057  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  32.34 
 
 
359 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2138  basic membrane lipoprotein  32.17 
 
 
390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3453  basic membrane lipoprotein  33.86 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.032757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1486  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 
386 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1766  basic membrane lipoprotein  33.07 
 
 
358 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0806  putative lipoprotein  34.05 
 
 
385 aa  195  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1118  basic membrane lipoprotein  30.81 
 
 
359 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0536373  normal  0.804172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2444  basic membrane lipoprotein  32.94 
 
 
382 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2146  basic membrane lipoprotein  32.28 
 
 
368 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233394  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5058  basic membrane lipoprotein  31.08 
 
 
365 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2964  putative basic membrane protein  32.98 
 
 
387 aa  189  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3721  basic membrane lipoprotein  32.89 
 
 
367 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0450  basic membrane lipoprotein  31.61 
 
 
625 aa  186  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3882  basic membrane lipoprotein  33.6 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3296  basic membrane lipoprotein  32.98 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1690  basic membrane lipoprotein  33.24 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00161056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1015  basic membrane lipoprotein  30.81 
 
 
362 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1903  basic membrane lipoprotein  33.06 
 
 
358 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.94528  normal  0.373123 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0493  basic membrane lipoprotein  31.37 
 
 
358 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00240976  normal  0.0511349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1719  basic membrane lipoprotein  32.79 
 
 
358 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00548824  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1142  basic membrane lipoprotein  32.7 
 
 
366 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111164  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5420  lipoprotein  32.54 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1044  basic membrane lipoprotein  31.99 
 
 
361 aa  173  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1001  basic membrane lipoprotein  31.45 
 
 
363 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5873  basic membrane lipoprotein  28.17 
 
 
364 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0769  bmp family protein  31.5 
 
 
374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.109974  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3152  basic membrane lipoprotein  31.98 
 
 
380 aa  163  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.445916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1159  bmp family protein  30.54 
 
 
363 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2076  basic membrane lipoprotein  33.16 
 
 
371 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0315473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1243  basic membrane lipoprotein  31.91 
 
 
379 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.202679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4847  basic membrane lipoprotein  30.43 
 
 
371 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4236  basic membrane lipoprotein  31.25 
 
 
360 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6457  basic membrane lipoprotein  30.81 
 
 
375 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.153955 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4465  basic membrane lipoprotein  26.78 
 
 
365 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117985 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4474  basic membrane lipoprotein  29.89 
 
 
375 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.766807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5243  basic membrane lipoprotein  31.22 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4620  ABC transporter substrate-binding protein  32.89 
 
 
369 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5659  lipoprotein  30.81 
 
 
422 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373529  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6465  basic membrane lipoprotein  27.05 
 
 
365 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866986  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0270  basic membrane lipoprotein  29.91 
 
 
372 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1368  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  30.69 
 
 
365 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0529921  normal  0.073818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>