More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3470 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1622  DNA topoisomerase IV subunit A  49.33 
 
 		 898 aa  790    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3470  DNA topoisomerase IV subunit A  100 
 
 		 977 aa  1991    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0658423 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0441  DNA topoisomerase IV subunit A  58.45 
 
 		 864 aa  943    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0128  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  50.71 
 
 		 697 aa  651    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0252875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2475  DNA topoisomerase IV subunit A  59.66 
 
 		 906 aa  976    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.118384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3108  DNA topoisomerase IV subunit A  57.11 
 
 		 846 aa  974    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.895744  normal  0.131946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0103  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48.44 
 
 		 708 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0825  DNA topoisomerase IV subunit A  53.31 
 
 		 832 aa  919    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.754544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2645  DNA topoisomerase IV subunit A  54.96 
 
 		 914 aa  953    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09723  DNA topoisomerase IV subunit A  56.03 
 
 		 897 aa  926    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.664108  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2227  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.9 
 
 		 904 aa  887    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0006877  normal  0.213389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1639  DNA topoisomerase IV subunit A  56.18 
 
 		 859 aa  958    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489152  normal  0.0780905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2118  DNA topoisomerase IV subunit A  39.21 
 
 		 703 aa  455  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.874859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0035  DNA topoisomerase IV subunit A  39.04 
 
 		 626 aa  449  1.0000000000000001e-124  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0031  DNA topoisomerase IV subunit A  39.78 
 
 		 490 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0738711  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2192  DNA gyrase, A subunit  29.05 
 
 		 853 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  30.9 
 
 		 893 aa  209  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2182  DNA gyrase subunit A  33.11 
 
 		 923 aa  208  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88662  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  38.99 
 
 		 922 aa  206  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0006  DNA gyrase, A subunit  31.47 
 
 		 840 aa  206  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000948225 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1016  DNA gyrase, A subunit  32.04 
 
 		 809 aa  206  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.0000125895  unclonable  0.0000000378482 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1058  DNA gyrase subunit A  38.99 
 
 		 934 aa  206  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  30.37 
 
 		 889 aa  204  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  29.25 
 
 		 807 aa  204  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  30.37 
 
 		 889 aa  204  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0737  DNA gyrase subunit A  37.05 
 
 		 928 aa  204  8e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0565103  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1186  DNA gyrase, A subunit  32.12 
 
 		 806 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1287  DNA gyrase subunit A  36.57 
 
 		 907 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  33.96 
 
 		 839 aa  203  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2630  DNA gyrase subunit A  36.57 
 
 		 907 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1029  DNA gyrase, A subunit  27.88 
 
 		 875 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.20578 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0006  DNA gyrase subunit A  30.56 
 
 		 834 aa  202  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0218004  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1166  DNA gyrase subunit A  38.02 
 
 		 904 aa  202  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0659198  normal  0.319448 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  34.76 
 
 		 907 aa  202  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  28.05 
 
 		 796 aa  202  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  33.96 
 
 		 839 aa  202  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  29.72 
 
 		 830 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3094  DNA gyrase, A subunit  36.36 
 
 		 848 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654737  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1848  DNA gyrase subunit A  33.6 
 
 		 922 aa  201  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409783  normal  0.837325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4371  DNA gyrase subunit A  39.1 
 
 		 915 aa  200  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289021  normal  0.322943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  34.81 
 
 		 923 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15810  DNA gyrase subunit A  34.32 
 
 		 910 aa  200  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.872955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  34.01 
 
 		 818 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2024  DNA gyrase, A subunit  31.96 
 
 		 841 aa  200  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0006  DNA gyrase, A subunit  30.79 
 
 		 828 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2232  DNA gyrase, A subunit  37.72 
 
 		 927 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1982  DNA topoisomerase IV subunit A  34.2 
 
 		 750 aa  199  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0348571  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  32.67 
 
 		 807 aa  198  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1476  DNA gyrase subunit A  37.72 
 
 		 913 aa  199  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0249688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5027  DNA gyrase, A subunit  34.42 
 
 		 911 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.0567458 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0456  DNA topoisomerase IV, A subunit  30.14 
 
 		 899 aa  198  4.0000000000000005e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.410296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0540  DNA gyrase subunit A  38.14 
 
 		 930 aa  198  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0267481  normal  0.364195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3884  DNA topoisomerase IV subunit A  34.99 
 
 		 745 aa  198  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4567  DNA gyrase, A subunit  34.42 
 
 		 911 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.205833 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1049  DNA gyrase, A subunit  34.55 
 
 		 838 aa  198  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385966  normal  0.255523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  36.23 
 
 		 912 aa  198  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  36.26 
 
 		 817 aa  198  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  29.66 
 
 		 949 aa  197  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3865  DNA gyrase subunit A  30.32 
 
 		 913 aa  197  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  33.5 
 
 		 835 aa  197  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  34.15 
 
 		 811 aa  197  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  29.01 
 
 		 802 aa  197  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3947  DNA gyrase subunit A  33.87 
 
 		 919 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00094025  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0006  DNA gyrase, A subunit  34.02 
 
 		 855 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1358  DNA gyrase subunit A  34.53 
 
 		 921 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.832857  normal  0.422434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2877  DNA topoisomerase IV subunit A  31.36 
 
 		 748 aa  197  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0187639  hitchhiker  0.0015107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2584  DNA gyrase, A subunit  27.44 
 
 		 879 aa  197  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568301  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1202  DNA gyrase subunit A  30.61 
 
 		 900 aa  196  2e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00734  DNA gyrase subunit A  33.61 
 
 		 898 aa  196  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.942934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2387  DNA topoisomerase  31.94 
 
 		 841 aa  196  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0699814  normal  0.399735 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0738  DNA gyrase subunit A  33.05 
 
 		 859 aa  196  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.958835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  36 
 
 		 848 aa  196  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  36.39 
 
 		 819 aa  195  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0771  DNA gyrase subunit A  33.61 
 
 		 889 aa  196  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.380841  hitchhiker  0.00768544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11750  DNA gyrase subunit A  34.86 
 
 		 796 aa  195  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0708355  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3009  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 878 aa  195  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.354996  normal  0.0330044 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0441  DNA gyrase, A subunit  34.31 
 
 		 810 aa  195  3e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.624683  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0842  DNA gyrase subunit A  33.61 
 
 		 889 aa  195  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18082  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0901  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 885 aa  195  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.018045  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  31.29 
 
 		 825 aa  195  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2578  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 904 aa  195  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  32.77 
 
 		 883 aa  195  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5084  DNA gyrase, A subunit  34.69 
 
 		 908 aa  195  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1571  DNA gyrase subunit A  33.61 
 
 		 880 aa  195  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612234  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0006  DNA gyrase subunit A  30.41 
 
 		 866 aa  195  4e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4719  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 888 aa  195  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.902316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  28.67 
 
 		 823 aa  194  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  28.67 
 
 		 823 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  28.67 
 
 		 823 aa  194  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  28.67 
 
 		 823 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0958  DNA gyrase, A subunit  35.68 
 
 		 869 aa  194  5e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.687987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2584  DNA gyrase subunit A  38.51 
 
 		 927 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216203  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 882 aa  195  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1263  DNA gyrase, A subunit  30.48 
 
 		 808 aa  194  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  28.85 
 
 		 823 aa  194  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2238  DNA gyrase subunit A  33.33 
 
 		 873 aa  194  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  28.67 
 
 		 823 aa  194  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  31.61 
 
 		 852 aa  194  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  28.84 
 
 		 823 aa  194  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1259  DNA gyrase, A subunit  36.42 
 
 		 870 aa  194  9e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>