More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2618 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 105 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4570  transcriptional regulator, ArsR family  80.95 
 
 		 106 aa  182  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.795405  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  77.14 
 
 		 106 aa  179  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  72.38 
 
 		 106 aa  172  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  66.35 
 
 		 108 aa  159  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  65.69 
 
 		 108 aa  149  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  56.19 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  56.19 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  50.48 
 
 		 107 aa  126  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  55.1 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  48.54 
 
 		 113 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  42.39 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0785  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 104 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  44.79 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3080  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  36.63 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6062  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1381  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1305  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  41.11 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  39.56 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1953  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  34.74 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2858  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.391276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19130  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4181  regulatory protein ArsR  37 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.903708  normal  0.092541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  33.66 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1014  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  34.41 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  42.68 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0935  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  32.65 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1557  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0493281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  34.65 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2881  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.915144  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  32 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0188  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2476  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135015  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>