More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2442 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.191582  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
271 aa  135  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
256 aa  125  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1015  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.01 
 
 
263 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1145  short chain dehydrogenase  31.01 
 
 
321 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.05 
 
 
266 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
257 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
266 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  30.2 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  30.2 
 
 
259 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  31.8 
 
 
258 aa  118  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.87 
 
 
263 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  32.14 
 
 
267 aa  115  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  31.28 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
266 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.63 
 
 
265 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  28.23 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.32 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
289 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
262 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.67 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
266 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
264 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 
261 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 
266 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
266 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5106  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
262 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311622  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  31.49 
 
 
264 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.16 
 
 
273 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
259 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 
267 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 
267 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
258 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
264 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 
272 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
291 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
264 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.03 
 
 
261 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000362575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
263 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
265 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
267 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
266 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.57 
 
 
257 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.4 
 
 
255 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000634692  hitchhiker  0.00117931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.21 
 
 
258 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 
266 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 
263 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
264 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.95 
 
 
270 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
270 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
260 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
271 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1901  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
266 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.49 
 
 
263 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.45 
 
 
266 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
250 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.39 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
255 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
269 aa  99.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  34.24 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  28.05 
 
 
264 aa  99  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 
283 aa  98.6  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
270 aa  99  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5551  putative short-chain dehydrogenase  27.27 
 
 
265 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0122  oxidoreductase  35.14 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.49595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.39 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.53 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.45 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708406  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>