93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3071 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  48.83 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  48.12 
 
 		 294 aa  248  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  48.83 
 
 		 296 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  47.83 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  45.07 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  44.52 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  42.11 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  42.11 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  41.55 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  41.2 
 
 		 311 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  42.51 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  41.11 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  40.77 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 305 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  44.01 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  40.27 
 
 		 324 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  38.28 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 351 aa  171  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 		 364 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  37.67 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  38.01 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  36.33 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  36.83 
 
 		 364 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  36.83 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  36.83 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  34.59 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  36.39 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  34.91 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  35.02 
 
 		 364 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  34.16 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  34.16 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  34.16 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  37.37 
 
 		 341 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  36.62 
 
 		 367 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  36.62 
 
 		 367 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  36.62 
 
 		 367 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  36.05 
 
 		 367 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  36.62 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  36.62 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  36.62 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  36.62 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  32.3 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  30.82 
 
 		 377 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  28.69 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  28.12 
 
 		 561 aa  73.2  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.59 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.9 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  37.5 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  28.68 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  30 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  30.56 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  29.69 
 
 		 414 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  33.91 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  31.9 
 
 		 357 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  28.15 
 
 		 217 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  29.75 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  33.91 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  32.5 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  32.73 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  30.52 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  30.33 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.9 
 
 		 370 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2978  hypothetical protein  29.48 
 
 		 382 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.157741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3068  hypothetical protein  29.48 
 
 		 380 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3176  hypothetical protein  29.48 
 
 		 380 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.649914  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  30.13 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2927  hypothetical protein  30.43 
 
 		 422 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.423308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 350 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  29.66 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.04 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1781  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 403 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.101415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  25.99 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  33.33 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  29.6 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  25.83 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 		 370 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  33.33 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  28.18 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 284 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  28.57 
 
 		 195 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  30.25 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  28.57 
 
 		 195 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  33.7 
 
 		 264 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 341 aa  42  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>