More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2786 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2786  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  40.08 
 
 
295 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2136  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  38.11 
 
 
280 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.264144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  35.19 
 
 
305 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  38.43 
 
 
285 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  35.19 
 
 
285 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  38.43 
 
 
285 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  35.19 
 
 
283 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  35.19 
 
 
283 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  39.68 
 
 
301 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  38.66 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  35.69 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  37.04 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  34.6 
 
 
294 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 
260 aa  135  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  31.84 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  34.15 
 
 
298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
284 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
271 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1944  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
249 aa  96.3  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  27.97 
 
 
260 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
266 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 
270 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.14 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
275 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  22.92 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
285 aa  72  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
291 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
291 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
291 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3161  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5070  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5207  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  39.5 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.93 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  26.12 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  27.2 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  24.6 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
283 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
386 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  26.56 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  23.27 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  36.52 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  25.19 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  23.33 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
340 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 
332 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.87 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  23.33 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
339 aa  65.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
354 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>