93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4169 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 390 aa  765    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  46.52 
 
 		 394 aa  316  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3978  hypothetical protein  88.89 
 
 		 205 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0673836  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 393 aa  206  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 		 415 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 397 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  32 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  34.23 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 402 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  32.11 
 
 		 408 aa  186  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 401 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  35.04 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  34.77 
 
 		 399 aa  180  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 419 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 423 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 398 aa  177  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  32.82 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 406 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  33.07 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 393 aa  173  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 406 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  31.79 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  31.77 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  35.41 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 409 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  31.32 
 
 		 375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  30.53 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 408 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 405 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 409 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 418 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  29.09 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  32.38 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  31.08 
 
 		 408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 408 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  32.12 
 
 		 417 aa  142  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  29.83 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  26.1 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  29.16 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  26.85 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  26.85 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 403 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  29.01 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  28.18 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  27.12 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  25.45 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  25.4 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  25.4 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  27.39 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  25.72 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  25.4 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 423 aa  57  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  26.05 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  26.05 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  24.73 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0467  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.343035 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  25.81 
 
 		 421 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 421 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>