157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2682 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  100 
 
 		 211 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  96.68 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  85.78 
 
 		 211 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  81.04 
 
 		 213 aa  364  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  81 
 
 		 214 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  83.85 
 
 		 205 aa  346  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  82.81 
 
 		 205 aa  340  9e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  66.98 
 
 		 218 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  66.98 
 
 		 218 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  67.13 
 
 		 218 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  67.13 
 
 		 218 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  67.62 
 
 		 215 aa  302  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  66.51 
 
 		 218 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  67.16 
 
 		 232 aa  286  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  66.5 
 
 		 212 aa  283  9e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  63.38 
 
 		 216 aa  283  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  65.5 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  64.9 
 
 		 212 aa  279  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  61.88 
 
 		 214 aa  278  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  62.19 
 
 		 219 aa  275  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  65.5 
 
 		 211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  64.71 
 
 		 217 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  63.55 
 
 		 235 aa  266  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  56.59 
 
 		 217 aa  255  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  54.5 
 
 		 211 aa  244  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  56.72 
 
 		 211 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  56.06 
 
 		 216 aa  241  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  55.78 
 
 		 216 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  53.62 
 
 		 216 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  55.22 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  52.66 
 
 		 216 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  54.27 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  55.61 
 
 		 206 aa  231  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  55.61 
 
 		 206 aa  231  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  54.95 
 
 		 210 aa  228  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  65.5 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  55.1 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  56.77 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  51.2 
 
 		 211 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  53.81 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  51.27 
 
 		 212 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  50.24 
 
 		 211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  53.76 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  51.02 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1593  urea carboxylase-associated protein 1  51.61 
 
 		 199 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  48.47 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  48.47 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  48.47 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  44.93 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  46.97 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  38.34 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  36.14 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  38.86 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  36.18 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  36.18 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  34.63 
 
 		 270 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  33.17 
 
 		 245 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  32.83 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  35.57 
 
 		 270 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  34.54 
 
 		 269 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  32.02 
 
 		 274 aa  114  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  31.77 
 
 		 279 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  32.51 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  32.2 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  36.55 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  36.55 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  36.55 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  33.5 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  32.02 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  33.51 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  31.34 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  31.16 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  31.16 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  32.68 
 
 		 270 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  30.65 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  34.16 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  35.05 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  31.37 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  34.9 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  30.58 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  35.87 
 
 		 280 aa  101  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  32.5 
 
 		 248 aa  101  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  31.22 
 
 		 273 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  36.32 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  32.5 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  31.77 
 
 		 273 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  30.93 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  34.02 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  34.02 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  31.03 
 
 		 257 aa  96.3  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  33.16 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  30.39 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  32.43 
 
 		 198 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  35 
 
 		 239 aa  94  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  32.64 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  32.16 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.75 
 
 		 781 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  32.64 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  30.85 
 
 		 287 aa  91.3  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>